source: branches/0.4/jobmond/jobmond.py @ 787

Last change on this file since 787 was 787, checked in by ramonb, 11 years ago
  • print import error (if any) details, i.e.: libtorque.so not found
  • Property svn:executable set to *
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 57.7 KB
RevLine 
[23]1#!/usr/bin/env python
[225]2#
3# This file is part of Jobmonarch
4#
[691]5# Copyright (C) 2006-2013  Ramon Bastiaans
[623]6# Copyright (C) 2007, 2009  Dave Love  (SGE code)
[225]7#
8# Jobmonarch is free software; you can redistribute it and/or modify
9# it under the terms of the GNU General Public License as published by
10# the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or
11# (at your option) any later version.
12#
13# Jobmonarch is distributed in the hope that it will be useful,
14# but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
15# MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
16# GNU General Public License for more details.
17#
18# You should have received a copy of the GNU General Public License
19# along with this program; if not, write to the Free Software
20# Foundation, Inc., 51 Franklin St, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA
21#
[228]22# SVN $Id: jobmond.py 787 2013-04-04 14:31:35Z ramonb $
[227]23#
[23]24
[694]25# vi :set ts=4
26
[471]27import sys, getopt, ConfigParser, time, os, socket, string, re
[784]28import xdrlib, socket, syslog, xml, xml.sax, shlex, os.path
[318]29from xml.sax.handler import feature_namespaces
[623]30from collections import deque
[699]31from glob import glob
[318]32
[691]33VERSION='0.4+SVN'
[307]34
[471]35def usage( ver ):
36
[691]37    print 'jobmond %s' %VERSION
[471]38
[691]39    if ver:
40        return 0
[471]41
[691]42    print
43    print 'Purpose:'
44    print '  The Job Monitoring Daemon (jobmond) reports batch jobs information and statistics'
45    print '  to Ganglia, which can be viewed with Job Monarch web frontend'
46    print
47    print 'Usage:    jobmond [OPTIONS]'
48    print
49    print '  -c, --config=FILE    The configuration file to use (default: /etc/jobmond.conf)'
50    print '  -p, --pidfile=FILE    Use pid file to store the process id'
51    print '  -h, --help        Print help and exit'
52    print '  -v, --version      Print version and exit'
53    print
[307]54
[212]55def processArgs( args ):
[26]56
[701]57    SHORT_L      = 'p:hvc:'
58    LONG_L       = [ 'help', 'config=', 'pidfile=', 'version' ]
[165]59
[704]60    global PIDFILE, JOBMOND_CONF
[701]61    PIDFILE      = None
[61]62
[701]63    JOBMOND_CONF = '/etc/jobmond.conf'
[354]64
[691]65    try:
[68]66
[691]67        opts, args    = getopt.getopt( args, SHORT_L, LONG_L )
[185]68
[691]69    except getopt.GetoptError, detail:
[212]70
[691]71        print detail
72        usage()
73        sys.exit( 1 )
[212]74
[691]75    for opt, value in opts:
[212]76
[691]77        if opt in [ '--config', '-c' ]:
78       
[701]79            JOBMOND_CONF = value
[212]80
[691]81        if opt in [ '--pidfile', '-p' ]:
[212]82
[701]83            PIDFILE      = value
[691]84       
85        if opt in [ '--help', '-h' ]:
[307]86 
[691]87            usage( False )
88            sys.exit( 0 )
[212]89
[691]90        if opt in [ '--version', '-v' ]:
[471]91
[691]92            usage( True )
93            sys.exit( 0 )
[471]94
[701]95    return loadConfig( JOBMOND_CONF )
[212]96
[520]97class GangliaConfigParser:
98
[699]99    def __init__( self, filename ):
[520]100
[699]101        self.conf_lijst   = [ ]
102        self.conf_dict    = { }
103        self.filename     = filename
104        self.file_pointer = file( filename, 'r' )
105        self.lexx         = shlex.shlex( self.file_pointer )
106        self.lexx.whitespace_split = True
[520]107
[699]108        self.parse()
[520]109
[699]110    def __del__( self ):
[520]111
[699]112        """
113        Cleanup: close file descriptor
114        """
115
116        self.file_pointer.close()
117        del self.lexx
118        del self.conf_lijst
119
[691]120    def removeQuotes( self, value ):
[520]121
[699]122        clean_value = value
123        clean_value = clean_value.replace( "'", "" )
124        clean_value = clean_value.replace( '"', '' )
125        clean_value = clean_value.strip()
[520]126
[691]127        return clean_value
[520]128
[699]129    def removeBraces( self, value ):
[520]130
[699]131        clean_value = value
132        clean_value = clean_value.replace( "(", "" )
133        clean_value = clean_value.replace( ')', '' )
134        clean_value = clean_value.strip()
[520]135
[699]136        return clean_value
[520]137
[699]138    def parse( self ):
[520]139
[699]140        """
141        Parse self.filename using shlex scanning.
142        - Removes /* comments */
143        - Traverses (recursively) through all include () statements
144        - Stores complete valid config tokens in self.conf_list
[520]145
[699]146        i.e.:
147            ['globals',
148             '{',
149             'daemonize',
150             '=',
151             'yes',
152             'setuid',
153             '=',
154             'yes',
155             'user',
156             '=',
157             'ganglia',
158             'debug_level',
159             '=',
160             '0',
161             <etc> ]
162        """
[520]163
[699]164        t = 'bogus'
165        c = False
166        i = False
[520]167
[699]168        while t != self.lexx.eof:
169            #print 'get token'
170            t = self.lexx.get_token()
[520]171
[699]172            if len( t ) >= 2:
[520]173
[699]174                if len( t ) >= 4:
[520]175
[699]176                    if t[:2] == '/*' and t[-2:] == '*/':
[520]177
[699]178                        #print 'comment line'
179                        #print 'skipping: %s' %t
180                        continue
[520]181
[699]182                if t == '/*' or t[:2] == '/*':
183                    c = True
184                    #print 'comment start'
185                    #print 'skipping: %s' %t
186                    continue
[520]187
[699]188                if t == '*/' or t[-2:] == '*/':
189                    c = False
190                    #print 'skipping: %s' %t
191                    #print 'comment end'
192                    continue
193
194            if c:
195                #print 'skipping: %s' %t
196                continue
197
198            if t == 'include':
199                i = True
200                #print 'include start'
201                #print 'skipping: %s' %t
202                continue
203
204            if i:
205
206                #print 'include start: %s' %t
207
208                t2 = self.removeQuotes( t )
209                t2 = self.removeBraces( t )
210
211                for in_file in glob( self.removeQuotes(t2) ):
212
213                    #print 'including file: %s' %in_file
214                    parse_infile = GangliaConfigParser( in_file )
215
216                    self.conf_lijst = self.conf_lijst + parse_infile.getConfLijst()
217
218                    del parse_infile
219
220                i = False
221                #print 'include end'
222                #print 'skipping: %s' %t
223                continue
224
225            #print 'keep: %s' %t
226            self.conf_lijst.append( self.removeQuotes(t) )
227
228    def getConfLijst( self ):
229
230        return self.conf_lijst
231
232    def confListToDict( self, parent_list=None ):
233
234        """
235        Recursively traverses a conf_list and creates dictionary from it
236        """
237
238        new_dict = { }
239        count    = 0
240        skip     = 0
241
242        if not parent_list:
243            parent_list = self.conf_lijst
244
245        #print 'entering confListToDict(): (parent) list size %s' %len(parent_list)
246
247        for n, c in enumerate( parent_list ):
248
249            count = count + 1
250
251            #print 'CL: n %d c %s' %(n, c)
252
253            if skip > 0:
254
255                #print '- skipped'
256                skip = skip - 1
257                continue
258
259            if (n+1) <= (len( parent_list )-1):
260
261                if parent_list[(n+1)] == '{':
262
263                    if not new_dict.has_key( c ):
264                        new_dict[ c ] = [ ]
265
266                    (temp_new_dict, skip) = self.confListToDict( parent_list[(n+2):] )
267                    new_dict[ c ].append( temp_new_dict )
268
269                if parent_list[(n+1)] == '=' and (n+2) <= (len( parent_list )-1):
270
271                    if not new_dict.has_key( c ):
272                        new_dict[ c ] = [ ]
273
274                    new_dict[ c ].append( parent_list[ (n+2) ] )
275
276                    skip = 2
277
278                if parent_list[n] == '}':
279
280                    #print 'leaving confListToDict(): new dict = %s' %new_dict
281                    return (new_dict, count)
282
283    def makeConfDict( self ):
284
285        """
286        Walks through self.conf_list and creates a dictionary based upon config values
287
288        i.e.:
289            'tcp_accept_channel': [{'acl': [{'access': [{'action': ['"allow"'],
290                                                         'ip': ['"127.0.0.1"'],
291                                                         'mask': ['32']}]}],
292                                    'port': ['8649']}],
293            'udp_recv_channel': [{'port': ['8649']}],
294            'udp_send_channel': [{'host': ['145.101.32.3'],
295                                  'port': ['8649']},
296                                 {'host': ['145.101.32.207'],
297                                  'port': ['8649']}]}
298        """
299
300        new_dict = { }
301        skip     = 0
302
303        #print 'entering makeConfDict()'
304
305        for n, c in enumerate( self.conf_lijst ):
306
307            #print 'M: n %d c %s' %(n, c)
308
309            if skip > 0:
310
311                #print '- skipped'
312                skip = skip - 1
313                continue
314
315            if (n+1) <= (len( self.conf_lijst )-1):
316
317                if self.conf_lijst[(n+1)] == '{':
318
319                    if not new_dict.has_key( c ):
320                        new_dict[ c ] = [ ]
321
322                    ( temp_new_dict, skip ) = self.confListToDict( self.conf_lijst[(n+2):] )
323                    new_dict[ c ].append( temp_new_dict )
324
325                if self.conf_lijst[(n+1)] == '=' and (n+2) <= (len( self.conf_lijst )-1):
326
327                    if not new_dict.has_key( c ):
328                        new_dict[ c ] = [ ]
329
330                    new_dict[ c ].append( self.conf_lijst[ (n+2) ] )
331
332                    skip = 2
333
334        self.conf_dict = new_dict
335        #print 'leaving makeConfDict(): conf dict size %d' %len( self.conf_dict )
336
337    def checkConfDict( self ):
338
339        if len( self.conf_lijst ) == 0:
340
341            raise Exception("Something went wrong generating conf list for %s" %self.file_name )
342
343        if len( self.conf_dict ) == 0:
344
345            self.makeConfDict()
346
347    def getConfDict( self ):
348
349        self.checkConfDict()
350        return self.conf_dict
351
352    def getUdpSendChannels( self ):
353
354        self.checkConfDict()
355
[707]356        udp_send_channels = [ ] # IP:PORT
357
358        if not self.conf_dict.has_key( 'udp_send_channel' ):
359            return None
360
361        for u in self.conf_dict[ 'udp_send_channel' ]:
362
363            if u.has_key( 'mcast_join' ):
364
365                ip = u['mcast_join'][0]
366
367            elif u.has_key( 'host' ):
368
369                ip = u['host'][0]
370
371            port = u['port'][0]
372
373            udp_send_channels.append( ( ip, port ) )
374
375        if len( udp_send_channels ) == 0:
376            return None
377
378        return udp_send_channels
379
[699]380    def getSectionLastOption( self, section, option ):
381
382        """
383        Get last option set in a config section that could be set multiple times in multiple (include) files.
384
385        i.e.: getSectionLastOption( 'globals', 'send_metadata_interval' )
386        """
387
388        self.checkConfDict()
389        value = None
390
391        if not self.conf_dict.has_key( section ):
392
393            return None
394
395        # Could be set multiple times in multiple (include) files: get last one set
396        for c in self.conf_dict[ section ]:
397
398                if c.has_key( option ):
399
[705]400                    value = c[ option ][0]
[699]401
[705]402        return value
[699]403
404    def getClusterName( self ):
405
406        return self.getSectionLastOption( 'cluster', 'name' )
407
408    def getVal( self, section, option ):
409
410        return self.getSectionLastOption( section, option )
411
[691]412    def getInt( self, section, valname ):
[520]413
[691]414        value    = self.getVal( section, valname )
[520]415
[691]416        if not value:
[699]417            return None
[520]418
[691]419        return int( value )
[520]420
[691]421    def getStr( self, section, valname ):
[520]422
[691]423        value    = self.getVal( section, valname )
[520]424
[691]425        if not value:
[699]426            return None
[520]427
[691]428        return str( value )
[520]429
430def findGmetric():
431
[691]432    for dir in os.path.expandvars( '$PATH' ).split( ':' ):
[520]433
[691]434        guess    = '%s/%s' %( dir, 'gmetric' )
[520]435
[691]436        if os.path.exists( guess ):
[520]437
[691]438            return guess
[520]439
[691]440    return False
[520]441
[212]442def loadConfig( filename ):
443
[691]444    def getlist( cfg_string ):
[215]445
[691]446        my_list = [ ]
[215]447
[691]448        for item_txt in cfg_string.split( ',' ):
[215]449
[691]450            sep_char = None
[215]451
[691]452            item_txt = item_txt.strip()
[215]453
[691]454            for s_char in [ "'", '"' ]:
[215]455
[691]456                if item_txt.find( s_char ) != -1:
[215]457
[691]458                    if item_txt.count( s_char ) != 2:
[215]459
[691]460                        print 'Missing quote: %s' %item_txt
461                        sys.exit( 1 )
[215]462
[691]463                    else:
[215]464
[691]465                        sep_char = s_char
466                        break
[215]467
[691]468            if sep_char:
[215]469
[691]470                item_txt = item_txt.split( sep_char )[1]
[215]471
[691]472            my_list.append( item_txt )
[215]473
[691]474        return my_list
[215]475
[784]476    if not os.path.isfile( JOBMOND_CONF ):
477
478        print "Is not a file or does not exist: '%s'" %JOBMOND_CONF
479        sys.exit( 1 )
480
481    try:
482        f = open( JOBMOND_CONF, 'r' )
483    except IOError, detail:
484        print "Cannot read config file: '%s'" %JOBMOND_CONF
485        sys.exit( 1 )
486    else:
487        f.close()
488
[691]489    cfg        = ConfigParser.ConfigParser()
[212]490
[691]491    cfg.read( filename )
[212]492
[691]493    global DEBUG_LEVEL, DAEMONIZE, BATCH_SERVER, BATCH_POLL_INTERVAL
494    global GMOND_CONF, DETECT_TIME_DIFFS, BATCH_HOST_TRANSLATE
495    global BATCH_API, QUEUE, GMETRIC_TARGET, USE_SYSLOG
496    global SYSLOG_LEVEL, SYSLOG_FACILITY, GMETRIC_BINARY
[707]497    global METRIC_MAX_VAL_LEN, GMOND_UDP_SEND_CHANNELS
[212]498
[701]499    DEBUG_LEVEL = cfg.getint( 'DEFAULT', 'DEBUG_LEVEL' )
[212]500
[701]501    DAEMONIZE   = cfg.getboolean( 'DEFAULT', 'DAEMONIZE' )
[212]502
[691]503    SYSLOG_LEVEL    = -1
[701]504    SYSLOG_FACILITY = None
[377]505
[691]506    try:
[701]507        USE_SYSLOG  = cfg.getboolean( 'DEFAULT', 'USE_SYSLOG' )
[212]508
[691]509    except ConfigParser.NoOptionError:
[373]510
[701]511        USE_SYSLOG  = True
[373]512
[691]513        debug_msg( 0, 'ERROR: no option USE_SYSLOG found: assuming yes' )
[373]514
[691]515    if USE_SYSLOG:
[373]516
[691]517        try:
[701]518            SYSLOG_LEVEL = cfg.getint( 'DEFAULT', 'SYSLOG_LEVEL' )
[373]519
[691]520        except ConfigParser.NoOptionError:
[373]521
[691]522            debug_msg( 0, 'ERROR: no option SYSLOG_LEVEL found: assuming level 0' )
[701]523            SYSLOG_LEVEL = 0
[373]524
[691]525        try:
[373]526
[691]527            SYSLOG_FACILITY = eval( 'syslog.LOG_' + cfg.get( 'DEFAULT', 'SYSLOG_FACILITY' ) )
[373]528
[691]529        except ConfigParser.NoOptionError:
[373]530
[691]531            SYSLOG_FACILITY = syslog.LOG_DAEMON
[373]532
[691]533            debug_msg( 0, 'ERROR: no option SYSLOG_FACILITY found: assuming facility DAEMON' )
[373]534
[691]535    try:
[373]536
[701]537        BATCH_SERVER = cfg.get( 'DEFAULT', 'BATCH_SERVER' )
[212]538
[691]539    except ConfigParser.NoOptionError:
[265]540
[691]541        # Backwards compatibility for old configs
542        #
[265]543
[701]544        BATCH_SERVER = cfg.get( 'DEFAULT', 'TORQUE_SERVER' )
545        api_guess    = 'pbs'
[691]546   
547    try:
548   
[701]549        BATCH_POLL_INTERVAL = cfg.getint( 'DEFAULT', 'BATCH_POLL_INTERVAL' )
[265]550
[691]551    except ConfigParser.NoOptionError:
[265]552
[691]553        # Backwards compatibility for old configs
554        #
[265]555
[701]556        BATCH_POLL_INTERVAL = cfg.getint( 'DEFAULT', 'TORQUE_POLL_INTERVAL' )
557        api_guess           = 'pbs'
[691]558   
559    try:
[212]560
[701]561        GMOND_CONF          = cfg.get( 'DEFAULT', 'GMOND_CONF' )
[353]562
[691]563    except ConfigParser.NoOptionError:
[353]564
[703]565        # Not specified: assume /etc/ganglia/gmond.conf
[691]566        #
[703]567        GMOND_CONF          = '/etc/ganglia/gmond.conf'
[353]568
[707]569    ganglia_cfg             = GangliaConfigParser( GMOND_CONF )
570    GMETRIC_TARGET          = None
[449]571
[707]572    GMOND_UDP_SEND_CHANNELS = ganglia_cfg.getUdpSendChannels()
[449]573
[707]574    if not GMOND_UDP_SEND_CHANNELS:
[449]575
[701]576        debug_msg( 0, "WARNING: Can't parse udp_send_channel from: '%s' - Trying: %s" %( GMOND_CONF, JOBMOND_CONF ) )
[520]577
[691]578        # Couldn't figure it out: let's see if it's in our jobmond.conf
579        #
580        try:
[520]581
[691]582            GMETRIC_TARGET    = cfg.get( 'DEFAULT', 'GMETRIC_TARGET' )
[520]583
[691]584        # Guess not: now just give up
[701]585       
[691]586        except ConfigParser.NoOptionError:
[520]587
[691]588            GMETRIC_TARGET    = None
[520]589
[691]590            debug_msg( 0, "ERROR: GMETRIC_TARGET not set: internal Gmetric handling aborted. Failing back to DEPRECATED use of gmond.conf/gmetric binary. This will slow down jobmond significantly!" )
[520]591
[701]592            gmetric_bin    = findGmetric()
[520]593
[701]594            if gmetric_bin:
[520]595
[701]596                GMETRIC_BINARY     = gmetric_bin
597            else:
598                debug_msg( 0, "WARNING: Can't find gmetric binary anywhere in $PATH" )
[520]599
[701]600                try:
[520]601
[701]602                    GMETRIC_BINARY = cfg.get( 'DEFAULT', 'GMETRIC_BINARY' )
[520]603
[701]604                except ConfigParser.NoOptionError:
[520]605
[786]606                    print "FATAL ERROR: GMETRIC_BINARY not set and not in $PATH"
[701]607                    sys.exit( 1 )
[520]608
[701]609    #TODO: is this really still needed or should be automatic
[691]610    DETECT_TIME_DIFFS    = cfg.getboolean( 'DEFAULT', 'DETECT_TIME_DIFFS' )
[212]611
[701]612    BATCH_HOST_TRANSLATE = getlist( cfg.get( 'DEFAULT', 'BATCH_HOST_TRANSLATE' ) )
[215]613
[691]614    try:
[256]615
[691]616        BATCH_API    = cfg.get( 'DEFAULT', 'BATCH_API' )
[266]617
[691]618    except ConfigParser.NoOptionError, detail:
[266]619
[691]620        if BATCH_SERVER and api_guess:
[354]621
[691]622            BATCH_API    = api_guess
623        else:
[786]624            print "FATAL ERROR: BATCH_API not set and can't make guess"
[691]625            sys.exit( 1 )
[317]626
[691]627    try:
[317]628
[691]629        QUEUE        = getlist( cfg.get( 'DEFAULT', 'QUEUE' ) )
[317]630
[691]631    except ConfigParser.NoOptionError, detail:
[317]632
[691]633        QUEUE        = None
[353]634
[701]635    METRIC_MAX_VAL_LEN = ganglia_cfg.getInt( 'globals', 'max_udp_msg_len' )
636
[691]637    return True
[212]638
[507]639def fqdn_parts (fqdn):
[520]640
[691]641    """Return pair of host and domain for fully-qualified domain name arg."""
[520]642
[691]643    parts = fqdn.split (".")
[520]644
[691]645    return (parts[0], string.join(parts[1:], "."))
[507]646
[61]647class DataProcessor:
[355]648
[691]649    """Class for processing of data"""
[61]650
[691]651    binary = None
[61]652
[691]653    def __init__( self, binary=None ):
[355]654
[691]655        """Remember alternate binary location if supplied"""
[61]656
[691]657        global GMETRIC_BINARY, GMOND_CONF
[449]658
[691]659        if binary:
660            self.binary = binary
[61]661
[707]662        if not self.binary and not GMETRIC_TARGET and not GMOND_UDP_SEND_CHANNELS:
[691]663            self.binary = GMETRIC_BINARY
[449]664
[691]665        # Timeout for XML
666        #
667        # From ganglia's documentation:
668        #
669        # 'A metric will be deleted DMAX seconds after it is received, and
670        # DMAX=0 means eternal life.'
[61]671
[691]672        self.dmax = str( int( int( BATCH_POLL_INTERVAL ) * 2 ) )
[80]673
[707]674        if GMOND_CONF and not GMETRIC_TARGET and not GMOND_UDP_SEND_CHANNELS:
[354]675
[691]676            incompatible = self.checkGmetricVersion()
[61]677
[691]678            if incompatible:
[355]679
[786]680                print 'Ganglia/Gmetric version not compatible, please upgrade to at least 3.4.0'
[691]681                sys.exit( 1 )
[65]682
[691]683    def checkGmetricVersion( self ):
[355]684
[691]685        """
[692]686        Check version of gmetric is at least 3.4.0
[691]687        for the syntax we use
688        """
[65]689
[691]690        global METRIC_MAX_VAL_LEN, GMETRIC_TARGET
[255]691
[691]692        incompatible    = 0
[341]693
[691]694        gfp        = os.popen( self.binary + ' --version' )
[692]695        lines      = gfp.readlines()
[65]696
[691]697        gfp.close()
[355]698
[691]699        for line in lines:
[355]700
[691]701            line = line.split( ' ' )
[65]702
[691]703            if len( line ) == 2 and str( line ).find( 'gmetric' ) != -1:
704           
705                gmetric_version    = line[1].split( '\n' )[0]
[65]706
[691]707                version_major    = int( gmetric_version.split( '.' )[0] )
708                version_minor    = int( gmetric_version.split( '.' )[1] )
709                version_patch    = int( gmetric_version.split( '.' )[2] )
[65]710
[691]711                incompatible    = 0
[65]712
[691]713                if version_major < 3:
[65]714
[691]715                    incompatible = 1
716               
717                elif version_major == 3:
[65]718
[692]719                    if version_minor < 4:
[65]720
[692]721                        incompatible = 1
[65]722
[691]723        return incompatible
[65]724
[691]725    def multicastGmetric( self, metricname, metricval, valtype='string', units='' ):
[355]726
[691]727        """Call gmetric binary and multicast"""
[65]728
[691]729        cmd = self.binary
[65]730
[707]731        if GMOND_UDP_SEND_CHANNELS:
[61]732
[707]733            for c_ip, c_port  in GMOND_UDP_SEND_CHANNELS:
734
735                metric_debug        = "[gmetric %s:%s] name: %s - val: %s - dmax: %s" %( str(c_ip), str(c_port), str( metricname ), str( metricval ), str( self.dmax ) )
736
737                debug_msg( 10, printTime() + ' ' + metric_debug)
738
739                gm = Gmetric( c_ip, c_port )
740
741                gm.send( str( metricname ), str( metricval ), str( self.dmax ), valtype, units )
742
743        elif GMETRIC_TARGET:
744
[691]745            GMETRIC_TARGET_HOST    = GMETRIC_TARGET.split( ':' )[0]
746            GMETRIC_TARGET_PORT    = GMETRIC_TARGET.split( ':' )[1]
[353]747
[691]748            metric_debug        = "[gmetric] name: %s - val: %s - dmax: %s" %( str( metricname ), str( metricval ), str( self.dmax ) )
[353]749
[691]750            debug_msg( 10, printTime() + ' ' + metric_debug)
[353]751
[691]752            gm = Gmetric( GMETRIC_TARGET_HOST, GMETRIC_TARGET_PORT )
[353]753
[691]754            gm.send( str( metricname ), str( metricval ), str( self.dmax ), valtype, units )
[353]755
[691]756        else:
757            try:
758                cmd = cmd + ' -c' + GMOND_CONF
[353]759
[691]760            except NameError:
[353]761
[705]762                debug_msg( 10, 'Assuming /etc/ganglia/gmond.conf for gmetric cmd' )
[353]763
[691]764            cmd = cmd + ' -n' + str( metricname )+ ' -v"' + str( metricval )+ '" -t' + str( valtype ) + ' -d' + str( self.dmax )
[353]765
[691]766            if len( units ) > 0:
[409]767
[691]768                cmd = cmd + ' -u"' + units + '"'
[409]769
[691]770            debug_msg( 10, printTime() + ' ' + cmd )
[353]771
[691]772            os.system( cmd )
[353]773
[318]774class DataGatherer:
[23]775
[691]776    """Skeleton class for batch system DataGatherer"""
[256]777
[691]778    def printJobs( self, jobs ):
[355]779
[691]780        """Print a jobinfo overview"""
[318]781
[691]782        for name, attrs in self.jobs.items():
[318]783
[691]784            print 'job %s' %(name)
[318]785
[691]786            for name, val in attrs.items():
[318]787
[691]788                print '\t%s = %s' %( name, val )
[318]789
[691]790    def printJob( self, jobs, job_id ):
[355]791
[691]792        """Print job with job_id from jobs"""
[318]793
[691]794        print 'job %s' %(job_id)
[318]795
[691]796        for name, val in jobs[ job_id ].items():
[318]797
[691]798            print '\t%s = %s' %( name, val )
[318]799
[691]800    def getAttr( self, attrs, name ):
[507]801
[691]802        """Return certain attribute from dictionary, if exists"""
[507]803
[691]804        if attrs.has_key( name ):
[507]805
[691]806            return attrs[ name ]
807        else:
808            return ''
[507]809
[691]810    def jobDataChanged( self, jobs, job_id, attrs ):
[507]811
[691]812        """Check if job with attrs and job_id in jobs has changed"""
[507]813
[691]814        if jobs.has_key( job_id ):
[507]815
[691]816            oldData = jobs[ job_id ]   
817        else:
818            return 1
[507]819
[691]820        for name, val in attrs.items():
[507]821
[691]822            if oldData.has_key( name ):
[507]823
[691]824                if oldData[ name ] != attrs[ name ]:
[507]825
[691]826                    return 1
[507]827
[691]828            else:
829                return 1
[507]830
[691]831        return 0
[507]832
[691]833    def submitJobData( self ):
[507]834
[691]835        """Submit job info list"""
[507]836
[691]837        global BATCH_API
[512]838
[728]839        self.dp.multicastGmetric( 'zplugin_monarch_heartbeat', str( int( int( self.cur_time ) + int( self.timeoffset ) ) ) )
[507]840
[724]841        running_jobs = 0
842        queued_jobs  = 0
[507]843
[691]844        # Count how many running/queued jobs we found
845        #
846        for jobid, jobattrs in self.jobs.items():
[507]847
[691]848            if jobattrs[ 'status' ] == 'Q':
[507]849
[691]850                queued_jobs += 1
[507]851
[691]852            elif jobattrs[ 'status' ] == 'R':
[507]853
[691]854                running_jobs += 1
[507]855
[691]856        # Report running/queued jobs as seperate metric for a nice RRD graph
857        #
[728]858        self.dp.multicastGmetric( 'zplugin_monarch_rj', str( running_jobs ), 'uint32', 'jobs' )
859        self.dp.multicastGmetric( 'zplugin_monarch_qj', str( queued_jobs ), 'uint32', 'jobs' )
[507]860
[691]861        # Report down/offline nodes in batch (PBS only ATM)
862        #
863        if BATCH_API == 'pbs':
[512]864
[691]865            domain        = fqdn_parts( socket.getfqdn() )[1]
[514]866
[728]867            downed_nodes  = list()
868            offline_nodes = list()
[691]869       
870            l        = ['state']
871       
872            for name, node in self.pq.getnodes().items():
[512]873
[691]874                if ( node[ 'state' ].find( "down" ) != -1 ):
[512]875
[691]876                    downed_nodes.append( name )
[512]877
[691]878                if ( node[ 'state' ].find( "offline" ) != -1 ):
[512]879
[691]880                    offline_nodes.append( name )
[512]881
[728]882            downnodeslist    = do_nodelist( downed_nodes )
883            offlinenodeslist = do_nodelist( offline_nodes )
[512]884
[691]885            down_str    = 'nodes=%s domain=%s reported=%s' %( string.join( downnodeslist, ';' ), domain, str( int( int( self.cur_time ) + int( self.timeoffset ) ) ) )
886            offl_str    = 'nodes=%s domain=%s reported=%s' %( string.join( offlinenodeslist, ';' ), domain, str( int( int( self.cur_time ) + int( self.timeoffset ) ) ) )
[728]887            self.dp.multicastGmetric( 'zplugin_monarch_down'   , down_str )
888            self.dp.multicastGmetric( 'zplugin_monarch_offline', offl_str )
[514]889
[691]890        # Now let's spread the knowledge
891        #
892        for jobid, jobattrs in self.jobs.items():
[507]893
[691]894            # Make gmetric values for each job: respect max gmetric value length
895            #
896            gmetric_val        = self.compileGmetricVal( jobid, jobattrs )
897            metric_increment    = 0
[507]898
[691]899            # If we have more job info than max gmetric value length allows, split it up
900            # amongst multiple metrics
901            #
902            for val in gmetric_val:
[507]903
[728]904                metric_name = 'zplugin_monarch_job_%s_%s' %( str(metric_increment) , str( jobid ) )
905                self.dp.multicastGmetric( metric_name, val )
[507]906
[691]907                # Increase follow number if this jobinfo is split up amongst more than 1 gmetric
908                #
909                metric_increment    = metric_increment + 1
[507]910
[691]911    def compileGmetricVal( self, jobid, jobattrs ):
[507]912
[691]913        """Create a val string for gmetric of jobinfo"""
[507]914
[691]915        gval_lists    = [ ]
916        val_list    = { }
[507]917
[691]918        for val_name, val_value in jobattrs.items():
[507]919
[691]920            # These are our own metric names, i.e.: status, start_timestamp, etc
921            #
922            val_list_names_len    = len( string.join( val_list.keys() ) ) + len(val_list.keys())
[507]923
[691]924            # These are their corresponding values
925            #
926            val_list_vals_len    = len( string.join( val_list.values() ) ) + len(val_list.values())
[507]927
[691]928            if val_name == 'nodes' and jobattrs['status'] == 'R':
[507]929
[691]930                node_str = None
[507]931
[691]932                for node in val_value:
[507]933
[691]934                    if node_str:
[507]935
[691]936                        node_str = node_str + ';' + node
937                    else:
938                        node_str = node
[507]939
[691]940                    # Make sure if we add this new info, that the total metric's value length does not exceed METRIC_MAX_VAL_LEN
941                    #
942                    if (val_list_names_len + len(val_name) ) + (val_list_vals_len + len(node_str) ) > METRIC_MAX_VAL_LEN:
[507]943
[691]944                        # It's too big, we need to make a new gmetric for the additional info
945                        #
946                        val_list[ val_name ]    = node_str
[507]947
[691]948                        gval_lists.append( val_list )
[507]949
[691]950                        val_list        = { }
951                        node_str        = None
[507]952
[691]953                val_list[ val_name ]    = node_str
[507]954
[691]955                gval_lists.append( val_list )
[507]956
[691]957                val_list        = { }
[507]958
[691]959            elif val_value != '':
[507]960
[691]961                # Make sure if we add this new info, that the total metric's value length does not exceed METRIC_MAX_VAL_LEN
962                #
963                if (val_list_names_len + len(val_name) ) + (val_list_vals_len + len(str(val_value)) ) > METRIC_MAX_VAL_LEN:
[507]964
[691]965                    # It's too big, we need to make a new gmetric for the additional info
966                    #
967                    gval_lists.append( val_list )
[507]968
[691]969                    val_list        = { }
[507]970
[691]971                val_list[ val_name ]    = val_value
[507]972
[691]973        if len( val_list ) > 0:
[507]974
[691]975            gval_lists.append( val_list )
[507]976
[691]977        str_list    = [ ]
[507]978
[691]979        # Now append the value names and values together, i.e.: stop_timestamp=value, etc
980        #
981        for val_list in gval_lists:
[507]982
[691]983            my_val_str    = None
[507]984
[691]985            for val_name, val_value in val_list.items():
[507]986
[691]987                if type(val_value) == list:
[579]988
[691]989                    val_value    = val_value.join( ',' )
[579]990
[691]991                if my_val_str:
[507]992
[691]993                    try:
994                        # fixme: It's getting
995                        # ('nodes', None) items
996                        my_val_str = my_val_str + ' ' + val_name + '=' + val_value
997                    except:
998                        pass
[623]999
[691]1000                else:
1001                    my_val_str = val_name + '=' + val_value
[507]1002
[691]1003            str_list.append( my_val_str )
[507]1004
[691]1005        return str_list
[507]1006
[691]1007    def daemon( self ):
[355]1008
[691]1009        """Run as daemon forever"""
[256]1010
[691]1011        # Fork the first child
1012        #
1013        pid = os.fork()
1014        if pid > 0:
1015            sys.exit(0)  # end parent
[256]1016
[691]1017        # creates a session and sets the process group ID
1018        #
1019        os.setsid()
[318]1020
[691]1021        # Fork the second child
1022        #
1023        pid = os.fork()
1024        if pid > 0:
1025            sys.exit(0)  # end parent
[318]1026
[691]1027        write_pidfile()
[318]1028
[691]1029        # Go to the root directory and set the umask
1030        #
1031        os.chdir('/')
1032        os.umask(0)
[318]1033
[691]1034        sys.stdin.close()
1035        sys.stdout.close()
1036        sys.stderr.close()
[318]1037
[691]1038        os.open('/dev/null', os.O_RDWR)
1039        os.dup2(0, 1)
1040        os.dup2(0, 2)
[318]1041
[691]1042        self.run()
[318]1043
[691]1044    def run( self ):
[355]1045
[691]1046        """Main thread"""
[256]1047
[691]1048        while ( 1 ):
1049       
1050            self.getJobData()
1051            self.submitJobData()
1052            time.sleep( BATCH_POLL_INTERVAL )   
[256]1053
[623]1054# SGE code by Dave Love <fx@gnu.org>.  Tested with SGE 6.0u8 and 6.0u11.  May
1055# work with SGE 6.1 (else should be easily fixable), but definitely doesn't
1056# with 6.2.  See also the fixmes.
[256]1057
[507]1058class NoJobs (Exception):
[691]1059    """Exception raised by empty job list in qstat output."""
1060    pass
[256]1061
[507]1062class SgeQstatXMLParser(xml.sax.handler.ContentHandler):
[691]1063    """SAX handler for XML output from Sun Grid Engine's `qstat'."""
[318]1064
[691]1065    def __init__(self):
1066        self.value = ""
1067        self.joblist = []
1068        self.job = {}
1069        self.queue = ""
1070        self.in_joblist = False
1071        self.lrequest = False
1072        self.eltq = deque()
1073        xml.sax.handler.ContentHandler.__init__(self)
[318]1074
[691]1075    # The structure of the output is as follows (for SGE 6.0).  It's
1076    # similar for 6.1, but radically different for 6.2, and is
1077    # undocumented generally.  Unfortunately it's voluminous, and probably
1078    # doesn't scale to large clusters/queues.
[318]1079
[691]1080    # <detailed_job_info  xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema">
1081    #   <djob_info>
1082    #     <qmaster_response>  <!-- job -->
1083    #       ...
1084    #       <JB_ja_template> 
1085    #     <ulong_sublist>
1086    #     ...         <!-- start_time, state ... -->
1087    #     </ulong_sublist>
1088    #       </JB_ja_template> 
1089    #       <JB_ja_tasks>
1090    #     <ulong_sublist>
1091    #       ...       <!-- task info
1092    #     </ulong_sublist>
1093    #     ...
1094    #       </JB_ja_tasks>
1095    #       ...
1096    #     </qmaster_response>
1097    #   </djob_info>
1098    #   <messages>
1099    #   ...
[318]1100
[691]1101    # NB.  We might treat each task as a separate job, like
1102    # straight qstat output, but the web interface expects jobs to
1103    # be identified by integers, not, say, <job number>.<task>.
[318]1104
[691]1105    # So, I lied.  If the job list is empty, we get invalid XML
1106    # like this, which we need to defend against:
[318]1107
[691]1108    # <unknown_jobs  xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema">
1109    #   <>
1110    #     <ST_name>*</ST_name>
1111    #   </>
1112    # </unknown_jobs>
[318]1113
[691]1114    def startElement(self, name, attrs):
1115        self.value = ""
1116        if name == "djob_info":    # job list
1117            self.in_joblist = True
1118        # The job container is "qmaster_response" in SGE 6.0
1119        # and 6.1, but "element" in 6.2.  This is only the very
1120        # start of what's necessary for 6.2, though (sigh).
1121        elif (name == "qmaster_response" or name == "element") \
1122                and self.eltq[-1] == "djob_info": # job
1123            self.job = {"job_state": "U", "slots": 0,
1124                    "nodes": [], "queued_timestamp": "",
1125                    "queued_timestamp": "", "queue": "",
1126                    "ppn": "0", "RN_max": 0,
1127                    # fixme in endElement
1128                    "requested_memory": 0, "requested_time": 0
1129                    }
1130            self.joblist.append(self.job)
1131        elif name == "qstat_l_requests": # resource request
1132            self.lrequest = True
1133        elif name == "unknown_jobs":
1134            raise NoJobs
1135        self.eltq.append (name)
[318]1136
[691]1137    def characters(self, ch):
1138        self.value += ch
[318]1139
[691]1140    def endElement(self, name): 
1141        """Snarf job elements contents into job dictionary.
1142           Translate keys if appropriate."""
[318]1143
[691]1144        name_trans = {
1145          "JB_job_number": "number",
1146          "JB_job_name": "name", "JB_owner": "owner",
1147          "queue_name": "queue", "JAT_start_time": "start_timestamp",
1148          "JB_submission_time": "queued_timestamp"
1149          }
1150        value = self.value
1151        self.eltq.pop ()
[318]1152
[691]1153        if name == "djob_info":
1154            self.in_joblist = False
1155            self.job = {}
1156        elif name == "JAT_master_queue":
1157            self.job["queue"] = value.split("@")[0]
1158        elif name == "JG_qhostname":
1159            if not (value in self.job["nodes"]):
1160                self.job["nodes"].append(value)
1161        elif name == "JG_slots": # slots in use
1162            self.job["slots"] += int(value)
1163        elif name == "RN_max": # requested slots (tasks or parallel)
1164            self.job["RN_max"] = max (self.job["RN_max"],
1165                          int(value))
1166        elif name == "JAT_state": # job state (bitwise or)
1167            value = int (value)
1168            # Status values from sge_jobL.h
1169            #define JIDLE           0x00000000
1170            #define JHELD           0x00000010
1171            #define JMIGRATING          0x00000020
1172            #define JQUEUED         0x00000040
1173            #define JRUNNING        0x00000080
1174            #define JSUSPENDED          0x00000100
1175            #define JTRANSFERING        0x00000200
1176            #define JDELETED        0x00000400
1177            #define JWAITING        0x00000800
1178            #define JEXITING        0x00001000
1179            #define JWRITTEN        0x00002000
1180            #define JSUSPENDED_ON_THRESHOLD 0x00010000
1181            #define JFINISHED           0x00010000
1182            if value & 0x80:
1183                self.job["status"] = "R"
1184            elif value & 0x40:
1185                self.job["status"] = "Q"
1186            else:
1187                self.job["status"] = "O" # `other'
1188        elif name == "CE_name" and self.lrequest and self.value in \
1189                ("h_cpu", "s_cpu", "cpu", "h_core", "s_core"):
1190            # We're in a container for an interesting resource
1191            # request; record which type.
1192            self.lrequest = self.value
1193        elif name == "CE_doubleval" and self.lrequest:
1194            # if we're in a container for an interesting
1195            # resource request, use the maxmimum of the hard
1196            # and soft requests to record the requested CPU
1197            # or core.  Fixme:  I'm not sure if this logic is
1198            # right.
1199            if self.lrequest in ("h_core", "s_core"):
1200                self.job["requested_memory"] = \
1201                    max (float (value),
1202                     self.job["requested_memory"])
1203            # Fixme:  Check what cpu means, c.f [hs]_cpu.
1204            elif self.lrequest in ("h_cpu", "s_cpu", "cpu"):
1205                self.job["requested_time"] = \
1206                    max (float (value),
1207                     self.job["requested_time"])
1208        elif name == "qstat_l_requests":
1209            self.lrequest = False
1210        elif self.job and self.in_joblist:
1211            if name in name_trans:
1212                name = name_trans[name]
1213                self.job[name] = value
[318]1214
[507]1215# Abstracted from PBS original.
1216# Fixme:  Is it worth (or appropriate for PBS) sorting the result?
[520]1217#
1218def do_nodelist( nodes ):
1219
[691]1220    """Translate node list as appropriate."""
[520]1221
[691]1222    nodeslist        = [ ]
1223    my_domain        = fqdn_parts( socket.getfqdn() )[1]
[520]1224
[691]1225    for node in nodes:
[520]1226
[691]1227        host        = node.split( '/' )[0] # not relevant for SGE
1228        h, host_domain    = fqdn_parts(host)
[520]1229
[691]1230        if host_domain == my_domain:
[520]1231
[691]1232            host    = h
[520]1233
[691]1234        if nodeslist.count( host ) == 0:
[520]1235
[691]1236            for translate_pattern in BATCH_HOST_TRANSLATE:
[520]1237
[691]1238                if translate_pattern.find( '/' ) != -1:
[520]1239
[691]1240                    translate_orig    = \
1241                        translate_pattern.split( '/' )[1]
1242                    translate_new    = \
1243                        translate_pattern.split( '/' )[2]
1244                    host = re.sub( translate_orig,
1245                               translate_new, host )
1246            if not host in nodeslist:
1247                nodeslist.append( host )
1248    return nodeslist
[318]1249
1250class SgeDataGatherer(DataGatherer):
1251
[691]1252    jobs = {}
[61]1253
[691]1254    def __init__( self ):
1255        self.jobs = {}
1256        self.timeoffset = 0
1257        self.dp = DataProcessor()
[318]1258
[691]1259    def getJobData( self ):
1260        """Gather all data on current jobs in SGE"""
[318]1261
[691]1262        import popen2
[318]1263
[691]1264        self.cur_time = 0
1265        queues = ""
1266        if QUEUE:    # only for specific queues
1267            # Fixme:  assumes queue names don't contain single
1268            # quote or comma.  Don't know what the SGE rules are.
1269            queues = " -q '" + string.join (QUEUE, ",") + "'"
1270        # Note the comment in SgeQstatXMLParser about scaling with
1271        # this method of getting data.  I haven't found better one.
1272        # Output with args `-xml -ext -f -r' is easier to parse
1273        # in some ways, harder in others, but it doesn't provide
1274        # the submission time (at least SGE 6.0).  The pipeline
1275        # into sed corrects bogus XML observed with a configuration
1276        # of SGE 6.0u8, which otherwise causes the parsing to hang.
1277        piping = popen2.Popen3("qstat -u '*' -j '*' -xml | \
[623]1278sed -e 's/reported usage>/reported_usage>/g' -e 's;<\/*JATASK:.*>;;'" \
[691]1279                           + queues, True)
1280        qstatparser = SgeQstatXMLParser()
1281        parse_err = 0
1282        try:
1283            xml.sax.parse(piping.fromchild, qstatparser)
1284        except NoJobs:
1285            pass
1286        except:
1287            parse_err = 1
[704]1288        if piping.wait():
1289            debug_msg(10, "qstat error, skipping until next polling interval: " + piping.childerr.readline())
[691]1290            return None
1291        elif parse_err:
1292            debug_msg(10, "Bad XML output from qstat"())
1293            exit (1)
1294        for f in piping.fromchild, piping.tochild, piping.childerr:
1295            f.close()
1296        self.cur_time = time.time()
1297        jobs_processed = []
1298        for job in qstatparser.joblist:
1299            job_id = job["number"]
1300            if job["status"] in [ 'Q', 'R' ]:
1301                jobs_processed.append(job_id)
1302            if job["status"] == "R":
1303                job["nodes"] = do_nodelist (job["nodes"])
1304                # Fixme: why is job["nodes"] sometimes null?
1305                try:
1306                    # Fixme: Is this sensible?  The
1307                    # PBS-type PPN isn't something you use
1308                    # with SGE.
[704]1309                    job["ppn"] = float(job["slots"]) / len(job["nodes"])
[691]1310                except:
1311                    job["ppn"] = 0
1312                if DETECT_TIME_DIFFS:
1313                    # If a job start is later than our
1314                    # current date, that must mean
1315                    # the SGE server's time is later
1316                    # than our local time.
[704]1317                    start_timestamp = int (job["start_timestamp"])
1318                    if start_timestamp > int(self.cur_time) + int(self.timeoffset):
[318]1319
[704]1320                        self.timeoffset    = start_timestamp - int(self.cur_time)
[691]1321            else:
1322                # fixme: Note sure what this should be:
1323                job["ppn"] = job["RN_max"]
1324                job["nodes"] = "1"
[318]1325
[691]1326            myAttrs = {}
1327            for attr in ["name", "queue", "owner",
1328                     "requested_time", "status",
1329                     "requested_memory", "ppn",
1330                     "start_timestamp", "queued_timestamp"]:
1331                myAttrs[attr] = str(job[attr])
1332            myAttrs["nodes"] = job["nodes"]
[704]1333            myAttrs["reported"] = str(int(self.cur_time) + int(self.timeoffset))
[691]1334            myAttrs["domain"] = fqdn_parts(socket.getfqdn())[1]
1335            myAttrs["poll_interval"] = str(BATCH_POLL_INTERVAL)
[318]1336
[704]1337            if self.jobDataChanged(self.jobs, job_id, myAttrs) and myAttrs["status"] in ["R", "Q"]:
[691]1338                self.jobs[job_id] = myAttrs
1339        for id, attrs in self.jobs.items():
1340            if id not in jobs_processed:
1341                del self.jobs[id]
[318]1342
[524]1343# LSF code by Mahmoud Hanafi <hanafim@users.sourceforge.nt>
1344# Requres LSFObject http://sourceforge.net/projects/lsfobject
1345#
1346class LsfDataGatherer(DataGatherer):
[525]1347
[691]1348    """This is the DataGatherer for LSf"""
[524]1349
[691]1350    global lsfObject
[524]1351
[691]1352    def __init__( self ):
[525]1353
[691]1354        self.jobs = { }
1355        self.timeoffset = 0
1356        self.dp = DataProcessor()
1357        self.initLsfQuery()
[524]1358
[691]1359    def _countDuplicatesInList( self, dupedList ):
[525]1360
[691]1361        countDupes    = { }
[525]1362
[691]1363        for item in dupedList:
[525]1364
[691]1365            if not countDupes.has_key( item ):
[525]1366
[691]1367                countDupes[ item ]    = 1
1368            else:
1369                countDupes[ item ]    = countDupes[ item ] + 1
[525]1370
[691]1371        dupeCountList    = [ ]
[525]1372
[691]1373        for item, count in countDupes.items():
[525]1374
[691]1375            dupeCountList.append( ( item, count ) )
[525]1376
[691]1377        return dupeCountList
[524]1378#
1379#lst = ['I1','I2','I1','I3','I4','I4','I7','I7','I7','I7','I7']
1380#print _countDuplicatesInList(lst)
1381#[('I1', 2), ('I3', 1), ('I2', 1), ('I4', 2), ('I7', 5)]
1382########################
1383
[691]1384    def initLsfQuery( self ):
1385        self.pq = None
1386        self.pq = lsfObject.jobInfoEntObject()
[524]1387
[691]1388    def getJobData( self, known_jobs="" ):
1389        """Gather all data on current jobs in LSF"""
1390        if len( known_jobs ) > 0:
1391            jobs = known_jobs
1392        else:
1393            jobs = { }
1394        joblist = {}
1395        joblist = self.pq.getJobInfo()
1396        nodelist = ''
[524]1397
[691]1398        self.cur_time = time.time()
[524]1399
[691]1400        jobs_processed = [ ]
[524]1401
[691]1402        for name, attrs in joblist.items():
1403            job_id = str(name)
1404            jobs_processed.append( job_id )
1405            name = self.getAttr( attrs, 'jobName' )
1406            queue = self.getAttr( self.getAttr( attrs, 'submit') , 'queue' )
1407            owner = self.getAttr( attrs, 'user' )
[524]1408
1409### THIS IS THE rLimit List index values
[691]1410#define LSF_RLIMIT_CPU      0        /* cpu time in milliseconds */
1411#define LSF_RLIMIT_FSIZE    1        /* maximum file size */
1412#define LSF_RLIMIT_DATA     2        /* data size */
1413#define LSF_RLIMIT_STACK    3        /* stack size */
1414#define LSF_RLIMIT_CORE     4        /* core file size */
1415#define LSF_RLIMIT_RSS      5        /* resident set size */
1416#define LSF_RLIMIT_NOFILE   6        /* open files */
1417#define LSF_RLIMIT_OPEN_MAX 7        /* (from HP-UX) */
1418#define LSF_RLIMIT_VMEM     8        /* maximum swap mem */
[524]1419#define LSF_RLIMIT_SWAP     8
[691]1420#define LSF_RLIMIT_RUN      9        /* max wall-clock time limit */
1421#define LSF_RLIMIT_PROCESS  10       /* process number limit */
1422#define LSF_RLIMIT_THREAD   11       /* thread number limit (introduced in LSF6.0) */
1423#define LSF_RLIM_NLIMITS    12       /* number of resource limits */
[524]1424
[691]1425            requested_time = self.getAttr( self.getAttr( attrs, 'submit') , 'rLimits' )[9]
1426            if requested_time == -1: 
1427                requested_time = ""
1428            requested_memory = self.getAttr( self.getAttr( attrs, 'submit') , 'rLimits' )[8]
1429            if requested_memory == -1: 
1430                requested_memory = ""
[524]1431# This tries to get proc per node. We don't support this right now
[691]1432            ppn = 0 #self.getAttr( self.getAttr( attrs, 'SubmitList') , 'numProessors' )
1433            requested_cpus = self.getAttr( self.getAttr( attrs, 'submit') , 'numProcessors' )
1434            if requested_cpus == None or requested_cpus == "":
1435                requested_cpus = 1
[524]1436
[691]1437            if QUEUE:
1438                for q in QUEUE:
1439                    if q == queue:
1440                        display_queue = 1
1441                        break
1442                    else:
1443                        display_queue = 0
1444                        continue
1445            if display_queue == 0:
1446                continue
[524]1447
[691]1448            runState = self.getAttr( attrs, 'status' )
1449            if runState == 4:
1450                status = 'R'
1451            else:
1452                status = 'Q'
1453            queued_timestamp = self.getAttr( attrs, 'submitTime' )
[524]1454
[691]1455            if status == 'R':
1456                start_timestamp = self.getAttr( attrs, 'startTime' )
1457                nodesCpu =  dict(self._countDuplicatesInList(self.getAttr( attrs, 'exHosts' )))
1458                nodelist = nodesCpu.keys()
[524]1459
[691]1460                if DETECT_TIME_DIFFS:
[524]1461
[691]1462                    # If a job start if later than our current date,
1463                    # that must mean the Torque server's time is later
1464                    # than our local time.
[524]1465
[691]1466                    if int(start_timestamp) > int( int(self.cur_time) + int(self.timeoffset) ):
[524]1467
[691]1468                        self.timeoffset = int( int(start_timestamp) - int(self.cur_time) )
[524]1469
[691]1470            elif status == 'Q':
1471                start_timestamp = ''
1472                count_mynodes = 0
1473                numeric_node = 1
1474                nodelist = ''
[524]1475
[691]1476            myAttrs = { }
1477            if name == "":
1478                myAttrs['name'] = "none"
1479            else:
1480                myAttrs['name'] = name
[524]1481
[691]1482            myAttrs[ 'owner' ]        = owner
1483            myAttrs[ 'requested_time' ]    = str(requested_time)
1484            myAttrs[ 'requested_memory' ]    = str(requested_memory)
1485            myAttrs[ 'requested_cpus' ]    = str(requested_cpus)
1486            myAttrs[ 'ppn' ]        = str( ppn )
1487            myAttrs[ 'status' ]        = status
1488            myAttrs[ 'start_timestamp' ]    = str(start_timestamp)
1489            myAttrs[ 'queue' ]        = str(queue)
1490            myAttrs[ 'queued_timestamp' ]    = str(queued_timestamp)
1491            myAttrs[ 'reported' ]        = str( int( int( self.cur_time ) + int( self.timeoffset ) ) )
1492            myAttrs[ 'nodes' ]        = do_nodelist( nodelist )
1493            myAttrs[ 'domain' ]        = fqdn_parts( socket.getfqdn() )[1]
1494            myAttrs[ 'poll_interval' ]    = str(BATCH_POLL_INTERVAL)
[524]1495
[691]1496            if self.jobDataChanged( jobs, job_id, myAttrs ) and myAttrs['status'] in [ 'R', 'Q' ]:
1497                jobs[ job_id ] = myAttrs
[524]1498
[691]1499                debug_msg( 10, printTime() + ' job %s state changed' %(job_id) )
[524]1500
[691]1501        for id, attrs in jobs.items():
1502            if id not in jobs_processed:
1503                # This one isn't there anymore
1504                #
1505                del jobs[ id ]
1506        self.jobs=jobs
[524]1507
1508
[355]1509class PbsDataGatherer( DataGatherer ):
[318]1510
[691]1511    """This is the DataGatherer for PBS and Torque"""
[318]1512
[691]1513    global PBSQuery, PBSError
[256]1514
[691]1515    def __init__( self ):
[354]1516
[691]1517        """Setup appropriate variables"""
[23]1518
[785]1519        self.jobs       = { }
1520        self.timeoffset = 0
1521        self.dp         = DataProcessor()
[354]1522
[691]1523        self.initPbsQuery()
[23]1524
[691]1525    def initPbsQuery( self ):
[91]1526
[785]1527        self.pq = None
[354]1528
[691]1529        if( BATCH_SERVER ):
[354]1530
[785]1531            self.pq = PBSQuery( BATCH_SERVER )
[691]1532        else:
[785]1533            self.pq = PBSQuery()
[91]1534
[691]1535        try:
1536            self.pq.old_data_structure()
[656]1537
[691]1538        except AttributeError:
[656]1539
[691]1540            # pbs_query is older
1541            #
1542            pass
[656]1543
[691]1544    def getJobData( self ):
[354]1545
[691]1546        """Gather all data on current jobs in Torque"""
[26]1547
[785]1548        joblist            = {}
1549        self.cur_time      = 0
[349]1550
[691]1551        try:
1552            joblist        = self.pq.getjobs()
[785]1553            self.cur_time  = time.time()
[354]1554
[691]1555        except PBSError, detail:
[354]1556
[691]1557            debug_msg( 10, "Caught PBS unavailable, skipping until next polling interval: " + str( detail ) )
1558            return None
[354]1559
[691]1560        jobs_processed    = [ ]
[26]1561
[691]1562        for name, attrs in joblist.items():
[785]1563            display_queue = 1
1564            job_id        = name.split( '.' )[0]
[26]1565
[785]1566            name          = self.getAttr( attrs, 'Job_Name' )
1567            queue         = self.getAttr( attrs, 'queue' )
[317]1568
[691]1569            if QUEUE:
1570                for q in QUEUE:
1571                    if q == queue:
1572                        display_queue = 1
1573                        break
1574                    else:
1575                        display_queue = 0
1576                        continue
1577            if display_queue == 0:
1578                continue
[317]1579
1580
[691]1581            owner            = self.getAttr( attrs, 'Job_Owner' ).split( '@' )[0]
[785]1582            requested_time   = self.getAttr( attrs, 'Resource_List.walltime' )
1583            requested_memory = self.getAttr( attrs, 'Resource_List.mem' )
[95]1584
[785]1585            mynoderequest    = self.getAttr( attrs, 'Resource_List.nodes' )
[95]1586
[785]1587            ppn = ''
[281]1588
[691]1589            if mynoderequest.find( ':' ) != -1 and mynoderequest.find( 'ppn' ) != -1:
[95]1590
[785]1591                mynoderequest_fields = mynoderequest.split( ':' )
[281]1592
[691]1593                for mynoderequest_field in mynoderequest_fields:
[281]1594
[691]1595                    if mynoderequest_field.find( 'ppn' ) != -1:
[281]1596
[785]1597                        ppn = mynoderequest_field.split( 'ppn=' )[1]
[281]1598
[785]1599            status = self.getAttr( attrs, 'job_state' )
[25]1600
[691]1601            if status in [ 'Q', 'R' ]:
[450]1602
[691]1603                jobs_processed.append( job_id )
[450]1604
[785]1605            queued_timestamp = self.getAttr( attrs, 'ctime' )
[243]1606
[691]1607            if status == 'R':
[133]1608
[785]1609                start_timestamp = self.getAttr( attrs, 'mtime' )
1610                nodes           = self.getAttr( attrs, 'exec_host' ).split( '+' )
[133]1611
[785]1612                nodeslist       = do_nodelist( nodes )
[354]1613
[691]1614                if DETECT_TIME_DIFFS:
[185]1615
[691]1616                    # If a job start if later than our current date,
1617                    # that must mean the Torque server's time is later
1618                    # than our local time.
1619               
1620                    if int( start_timestamp ) > int( int( self.cur_time ) + int( self.timeoffset ) ):
[185]1621
[785]1622                        self.timeoffset = int( int(start_timestamp) - int(self.cur_time) )
[185]1623
[691]1624            elif status == 'Q':
[95]1625
[691]1626                # 'mynodequest' can be a string in the following syntax according to the
1627                # Torque Administator's manual:
1628                #
1629                # {<node_count> | <hostname>}[:ppn=<ppn>][:<property>[:<property>]...][+ ...]
1630                # {<node_count> | <hostname>}[:ppn=<ppn>][:<property>[:<property>]...][+ ...]
1631                # etc
1632                #
[451]1633
[691]1634                #
1635                # For now we only count the amount of nodes request and ignore properties
1636                #
[451]1637
[785]1638                start_timestamp = ''
1639                count_mynodes   = 0
[354]1640
[691]1641                for node in mynoderequest.split( '+' ):
[67]1642
[691]1643                    # Just grab the {node_count|hostname} part and ignore properties
1644                    #
[785]1645                    nodepart     = node.split( ':' )[0]
[67]1646
[691]1647                    # Let's assume a node_count value
1648                    #
[785]1649                    numeric_node = 1
[451]1650
[691]1651                    # Chop the value up into characters
1652                    #
1653                    for letter in nodepart:
[67]1654
[691]1655                        # If this char is not a digit (0-9), this must be a hostname
1656                        #
1657                        if letter not in string.digits:
[133]1658
[785]1659                            numeric_node = 0
[133]1660
[691]1661                    # If this is a hostname, just count this as one (1) node
1662                    #
1663                    if not numeric_node:
[354]1664
[785]1665                        count_mynodes = count_mynodes + 1
[691]1666                    else:
[451]1667
[691]1668                        # If this a number, it must be the node_count
1669                        # and increase our count with it's value
1670                        #
1671                        try:
[785]1672                            count_mynodes = count_mynodes + int( nodepart )
[354]1673
[691]1674                        except ValueError, detail:
[354]1675
[691]1676                            # When we arrive here I must be bugged or very confused
1677                            # THIS SHOULD NOT HAPPEN!
1678                            #
1679                            debug_msg( 10, str( detail ) )
1680                            debug_msg( 10, "Encountered weird node in Resources_List?!" )
1681                            debug_msg( 10, 'nodepart = ' + str( nodepart ) )
1682                            debug_msg( 10, 'job = ' + str( name ) )
1683                            debug_msg( 10, 'attrs = ' + str( attrs ) )
1684                       
[785]1685                nodeslist       = str( count_mynodes )
[691]1686            else:
[785]1687                start_timestamp = ''
1688                nodeslist       = ''
[133]1689
[691]1690            myAttrs                = { }
[26]1691
[785]1692            myAttrs[ 'name' ]             = str( name )
1693            myAttrs[ 'queue' ]            = str( queue )
1694            myAttrs[ 'owner' ]            = str( owner )
1695            myAttrs[ 'requested_time' ]   = str( requested_time )
1696            myAttrs[ 'requested_memory' ] = str( requested_memory )
1697            myAttrs[ 'ppn' ]              = str( ppn )
1698            myAttrs[ 'status' ]           = str( status )
1699            myAttrs[ 'start_timestamp' ]  = str( start_timestamp )
1700            myAttrs[ 'queued_timestamp' ] = str( queued_timestamp )
1701            myAttrs[ 'reported' ]         = str( int( int( self.cur_time ) + int( self.timeoffset ) ) )
1702            myAttrs[ 'nodes' ]            = nodeslist
1703            myAttrs[ 'domain' ]           = fqdn_parts( socket.getfqdn() )[1]
[691]1704            myAttrs[ 'poll_interval' ]    = str( BATCH_POLL_INTERVAL )
[354]1705
[691]1706            if self.jobDataChanged( self.jobs, job_id, myAttrs ) and myAttrs['status'] in [ 'R', 'Q' ]:
[61]1707
[785]1708                self.jobs[ job_id ] = myAttrs
[26]1709
[691]1710        for id, attrs in self.jobs.items():
[76]1711
[691]1712            if id not in jobs_processed:
[76]1713
[691]1714                # This one isn't there anymore; toedeledoki!
1715                #
1716                del self.jobs[ id ]
[76]1717
[362]1718GMETRIC_DEFAULT_TYPE    = 'string'
1719GMETRIC_DEFAULT_HOST    = '127.0.0.1'
1720GMETRIC_DEFAULT_PORT    = '8649'
[700]1721GMETRIC_DEFAULT_UNITS   = ''
[362]1722
1723class Gmetric:
1724
[691]1725    global GMETRIC_DEFAULT_HOST, GMETRIC_DEFAULT_PORT
[362]1726
[700]1727    slope           = { 'zero' : 0, 'positive' : 1, 'negative' : 2, 'both' : 3, 'unspecified' : 4 }
1728    type            = ( '', 'string', 'uint16', 'int16', 'uint32', 'int32', 'float', 'double', 'timestamp' )
1729    protocol        = ( 'udp', 'multicast' )
[362]1730
[691]1731    def __init__( self, host=GMETRIC_DEFAULT_HOST, port=GMETRIC_DEFAULT_PORT ):
[700]1732               
[691]1733        global GMETRIC_DEFAULT_TYPE
[362]1734
[691]1735        self.prot       = self.checkHostProtocol( host )
[700]1736        self.data_msg   = xdrlib.Packer()
1737        self.meta_msg   = xdrlib.Packer()
[691]1738        self.socket     = socket.socket( socket.AF_INET, socket.SOCK_DGRAM )
[362]1739
[691]1740        if self.prot not in self.protocol:
[362]1741
[691]1742            raise ValueError( "Protocol must be one of: " + str( self.protocol ) )
[362]1743
[691]1744        if self.prot == 'multicast':
[362]1745
[691]1746            # Set multicast options
1747            #
1748            self.socket.setsockopt( socket.IPPROTO_IP, socket.IP_MULTICAST_TTL, 20 )
[362]1749
[691]1750        self.hostport   = ( host, int( port ) )
1751        self.slopestr   = 'both'
1752        self.tmax       = 60
[362]1753
[691]1754    def checkHostProtocol( self, ip ):
[362]1755
[691]1756        """Detect if a ip adress is a multicast address"""
[471]1757
[691]1758        MULTICAST_ADDRESS_MIN   = ( "224", "0", "0", "0" )
1759        MULTICAST_ADDRESS_MAX   = ( "239", "255", "255", "255" )
[362]1760
[700]1761        ip_fields               = ip.split( '.' )
[362]1762
[691]1763        if ip_fields >= MULTICAST_ADDRESS_MIN and ip_fields <= MULTICAST_ADDRESS_MAX:
[362]1764
[691]1765            return 'multicast'
1766        else:
1767            return 'udp'
[362]1768
[691]1769    def send( self, name, value, dmax, typestr = '', units = '' ):
[362]1770
[691]1771        if len( units ) == 0:
[700]1772            units       = GMETRIC_DEFAULT_UNITS
[471]1773
[691]1774        if len( typestr ) == 0:
[700]1775            typestr     = GMETRIC_DEFAULT_TYPE
[362]1776
[700]1777        (meta_msg, data_msg) = self.makexdr( name, value, typestr, units, self.slopestr, self.tmax, dmax )
[409]1778
[700]1779        meta_rt = self.socket.sendto( meta_msg, self.hostport )
1780        data_rt = self.socket.sendto( data_msg, self.hostport )
[362]1781
[700]1782        return ( meta_rt, data_rt )
[362]1783
[700]1784    def makexdr( self, name, value, typestr, unitstr, slopestr, tmax, dmax, group=None, spoof=None ):
1785
1786        hostname = "unset"
1787
[691]1788        if slopestr not in self.slope:
[362]1789
[691]1790            raise ValueError( "Slope must be one of: " + str( self.slope.keys() ) )
[362]1791
[691]1792        if typestr not in self.type:
[362]1793
[691]1794            raise ValueError( "Type must be one of: " + str( self.type ) )
[362]1795
[691]1796        if len( name ) == 0:
[362]1797
[691]1798            raise ValueError( "Name must be non-empty" )
[362]1799
[700]1800        self.meta_msg.reset()
1801        self.meta_msg.pack_int( 128 )
[362]1802
[700]1803        if not spoof:
1804            self.meta_msg.pack_string( hostname )
1805        else:
1806            self.meta_msg.pack_string( spoof )
[362]1807
[700]1808        self.meta_msg.pack_string( name )
1809
1810        if not spoof:
1811            self.meta_msg.pack_int( 0 )
1812        else:
1813            self.meta_msg.pack_int( 1 )
1814           
1815        self.meta_msg.pack_string( typestr )
1816        self.meta_msg.pack_string( name )
1817        self.meta_msg.pack_string( unitstr )
1818        self.meta_msg.pack_int( self.slope[ slopestr ] )
1819        self.meta_msg.pack_uint( int( tmax ) )
1820        self.meta_msg.pack_uint( int( dmax ) )
1821
1822        if not group:
1823            self.meta_msg.pack_int( 0 )
1824        else:
1825            self.meta_msg.pack_int( 1 )
1826            self.meta_msg.pack_string( "GROUP" )
1827            self.meta_msg.pack_string( group )
1828
1829        self.data_msg.reset()
1830        self.data_msg.pack_int( 128+5 )
1831
1832        if not spoof:
1833            self.data_msg.pack_string( hostname )
1834        else:
1835            self.data_msg.pack_string( spoof )
1836
1837        self.data_msg.pack_string( name )
1838
1839        if not spoof:
1840            self.data_msg.pack_int( 0 )
1841        else:
1842            self.data_msg.pack_int( 1 )
1843
1844        self.data_msg.pack_string( "%s" )
1845        self.data_msg.pack_string( str( value ) )
1846
1847        return ( self.meta_msg.get_buffer(), self.data_msg.get_buffer() )
1848
[26]1849def printTime( ):
[354]1850
[691]1851    """Print current time/date in human readable format for log/debug"""
[26]1852
[691]1853    return time.strftime("%a, %d %b %Y %H:%M:%S")
[26]1854
1855def debug_msg( level, msg ):
[354]1856
[691]1857    """Print msg if at or above current debug level"""
[26]1858
[691]1859    global DAEMONIZE, DEBUG_LEVEL, SYSLOG_LEVEL
[377]1860
[691]1861    if (not DAEMONIZE and DEBUG_LEVEL >= level):
1862        sys.stderr.write( msg + '\n' )
[26]1863
[691]1864    if (DAEMONIZE and USE_SYSLOG and SYSLOG_LEVEL >= level):
1865        syslog.syslog( msg )
[373]1866
[307]1867def write_pidfile():
1868
[691]1869    # Write pidfile if PIDFILE is set
1870    #
1871    if PIDFILE:
[307]1872
[691]1873        pid    = os.getpid()
[354]1874
[691]1875        pidfile    = open( PIDFILE, 'w' )
[354]1876
[691]1877        pidfile.write( str( pid ) )
1878        pidfile.close()
[307]1879
[23]1880def main():
[354]1881
[691]1882    """Application start"""
[23]1883
[691]1884    global PBSQuery, PBSError, lsfObject
1885    global SYSLOG_FACILITY, USE_SYSLOG, BATCH_API, DAEMONIZE
[256]1886
[691]1887    if not processArgs( sys.argv[1:] ):
[354]1888
[691]1889        sys.exit( 1 )
[212]1890
[691]1891    # Load appropriate DataGatherer depending on which BATCH_API is set
1892    # and any required modules for the Gatherer
1893    #
1894    if BATCH_API == 'pbs':
[256]1895
[691]1896        try:
1897            from PBSQuery import PBSQuery, PBSError
[256]1898
[787]1899        except ImportError, details:
[256]1900
[787]1901            print "FATAL ERROR: BATCH_API set to 'pbs' but python module 'pbs_python' cannot be loaded"
1902            print details
[691]1903            sys.exit( 1 )
[256]1904
[691]1905        gather = PbsDataGatherer()
[256]1906
[691]1907    elif BATCH_API == 'sge':
[256]1908
[691]1909        # Tested with SGE 6.0u11.
1910        #
1911        gather = SgeDataGatherer()
[368]1912
[691]1913    elif BATCH_API == 'lsf':
[368]1914
[691]1915        try:
1916            from lsfObject import lsfObject
1917        except:
[786]1918            print "FATAL ERROR: BATCH_API set to 'lsf' but python module is not found or installed"
[691]1919            sys.exit( 1)
[256]1920
[691]1921        gather = LsfDataGatherer()
[524]1922
[691]1923    else:
[786]1924        print "FATAL ERROR: unknown BATCH_API '" + BATCH_API + "' is not supported"
[354]1925
[691]1926        sys.exit( 1 )
[256]1927
[691]1928    if( DAEMONIZE and USE_SYSLOG ):
[373]1929
[691]1930        syslog.openlog( 'jobmond', syslog.LOG_NOWAIT, SYSLOG_FACILITY )
[373]1931
[691]1932    if DAEMONIZE:
[354]1933
[691]1934        gather.daemon()
1935    else:
1936        gather.run()
[23]1937
[256]1938# wh00t? someone started me! :)
[65]1939#
[23]1940if __name__ == '__main__':
[691]1941    main()
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.