source: branches/0.4/jobmond/jobmond.py @ 789

Last change on this file since 789 was 789, checked in by ramonb, 11 years ago
  • note to self: TODO
  • Property svn:executable set to *
  • Property svn:keywords set to Id
File size: 57.9 KB
Line 
1#!/usr/bin/env python
2#
3# This file is part of Jobmonarch
4#
5# Copyright (C) 2006-2013  Ramon Bastiaans
6# Copyright (C) 2007, 2009  Dave Love  (SGE code)
7#
8# Jobmonarch is free software; you can redistribute it and/or modify
9# it under the terms of the GNU General Public License as published by
10# the Free Software Foundation; either version 2 of the License, or
11# (at your option) any later version.
12#
13# Jobmonarch is distributed in the hope that it will be useful,
14# but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
15# MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE.  See the
16# GNU General Public License for more details.
17#
18# You should have received a copy of the GNU General Public License
19# along with this program; if not, write to the Free Software
20# Foundation, Inc., 51 Franklin St, Fifth Floor, Boston, MA  02110-1301  USA
21#
22# SVN $Id: jobmond.py 789 2013-04-04 14:57:18Z ramonb $
23#
24
25# vi :set ts=4
26
27import sys, getopt, ConfigParser, time, os, socket, string, re
28import xdrlib, socket, syslog, xml, xml.sax, shlex, os.path
29from xml.sax.handler import feature_namespaces
30from collections import deque
31from glob import glob
32
33VERSION='0.4+SVN'
34
35def usage( ver ):
36
37    print 'jobmond %s' %VERSION
38
39    if ver:
40        return 0
41
42    print
43    print 'Purpose:'
44    print '  The Job Monitoring Daemon (jobmond) reports batch jobs information and statistics'
45    print '  to Ganglia, which can be viewed with Job Monarch web frontend'
46    print
47    print 'Usage:    jobmond [OPTIONS]'
48    print
49    print '  -c, --config=FILE    The configuration file to use (default: /etc/jobmond.conf)'
50    print '  -p, --pidfile=FILE    Use pid file to store the process id'
51    print '  -h, --help        Print help and exit'
52    print '  -v, --version      Print version and exit'
53    print
54
55def processArgs( args ):
56
57    SHORT_L      = 'p:hvc:'
58    LONG_L       = [ 'help', 'config=', 'pidfile=', 'version' ]
59
60    global PIDFILE, JOBMOND_CONF
61    PIDFILE      = None
62
63    JOBMOND_CONF = '/etc/jobmond.conf'
64
65    try:
66
67        opts, args    = getopt.getopt( args, SHORT_L, LONG_L )
68
69    except getopt.GetoptError, detail:
70
71        print detail
72        usage()
73        sys.exit( 1 )
74
75    for opt, value in opts:
76
77        if opt in [ '--config', '-c' ]:
78       
79            JOBMOND_CONF = value
80
81        if opt in [ '--pidfile', '-p' ]:
82
83            PIDFILE      = value
84       
85        if opt in [ '--help', '-h' ]:
86 
87            usage( False )
88            sys.exit( 0 )
89
90        if opt in [ '--version', '-v' ]:
91
92            usage( True )
93            sys.exit( 0 )
94
95    return loadConfig( JOBMOND_CONF )
96
97class GangliaConfigParser:
98
99    def __init__( self, filename ):
100
101        self.conf_lijst   = [ ]
102        self.conf_dict    = { }
103        self.filename     = filename
104        self.file_pointer = file( filename, 'r' )
105        self.lexx         = shlex.shlex( self.file_pointer )
106        self.lexx.whitespace_split = True
107
108        self.parse()
109
110    def __del__( self ):
111
112        """
113        Cleanup: close file descriptor
114        """
115
116        self.file_pointer.close()
117        del self.lexx
118        del self.conf_lijst
119
120    def removeQuotes( self, value ):
121
122        clean_value = value
123        clean_value = clean_value.replace( "'", "" )
124        clean_value = clean_value.replace( '"', '' )
125        clean_value = clean_value.strip()
126
127        return clean_value
128
129    def removeBraces( self, value ):
130
131        clean_value = value
132        clean_value = clean_value.replace( "(", "" )
133        clean_value = clean_value.replace( ')', '' )
134        clean_value = clean_value.strip()
135
136        return clean_value
137
138    def parse( self ):
139
140        """
141        Parse self.filename using shlex scanning.
142        - Removes /* comments */
143        - Traverses (recursively) through all include () statements
144        - Stores complete valid config tokens in self.conf_list
145
146        i.e.:
147            ['globals',
148             '{',
149             'daemonize',
150             '=',
151             'yes',
152             'setuid',
153             '=',
154             'yes',
155             'user',
156             '=',
157             'ganglia',
158             'debug_level',
159             '=',
160             '0',
161             <etc> ]
162        """
163
164        t = 'bogus'
165        c = False
166        i = False
167
168        while t != self.lexx.eof:
169            #print 'get token'
170            t = self.lexx.get_token()
171
172            if len( t ) >= 2:
173
174                if len( t ) >= 4:
175
176                    if t[:2] == '/*' and t[-2:] == '*/':
177
178                        #print 'comment line'
179                        #print 'skipping: %s' %t
180                        continue
181
182                if t == '/*' or t[:2] == '/*':
183                    c = True
184                    #print 'comment start'
185                    #print 'skipping: %s' %t
186                    continue
187
188                if t == '*/' or t[-2:] == '*/':
189                    c = False
190                    #print 'skipping: %s' %t
191                    #print 'comment end'
192                    continue
193
194            if c:
195                #print 'skipping: %s' %t
196                continue
197
198            if t == 'include':
199                i = True
200                #print 'include start'
201                #print 'skipping: %s' %t
202                continue
203
204            if i:
205
206                #print 'include start: %s' %t
207
208                t2 = self.removeQuotes( t )
209                t2 = self.removeBraces( t )
210
211                for in_file in glob( self.removeQuotes(t2) ):
212
213                    #print 'including file: %s' %in_file
214                    parse_infile = GangliaConfigParser( in_file )
215
216                    self.conf_lijst = self.conf_lijst + parse_infile.getConfLijst()
217
218                    del parse_infile
219
220                i = False
221                #print 'include end'
222                #print 'skipping: %s' %t
223                continue
224
225            #print 'keep: %s' %t
226            self.conf_lijst.append( self.removeQuotes(t) )
227
228    def getConfLijst( self ):
229
230        return self.conf_lijst
231
232    def confListToDict( self, parent_list=None ):
233
234        """
235        Recursively traverses a conf_list and creates dictionary from it
236        """
237
238        new_dict = { }
239        count    = 0
240        skip     = 0
241
242        if not parent_list:
243            parent_list = self.conf_lijst
244
245        #print 'entering confListToDict(): (parent) list size %s' %len(parent_list)
246
247        for n, c in enumerate( parent_list ):
248
249            count = count + 1
250
251            #print 'CL: n %d c %s' %(n, c)
252
253            if skip > 0:
254
255                #print '- skipped'
256                skip = skip - 1
257                continue
258
259            if (n+1) <= (len( parent_list )-1):
260
261                if parent_list[(n+1)] == '{':
262
263                    if not new_dict.has_key( c ):
264                        new_dict[ c ] = [ ]
265
266                    (temp_new_dict, skip) = self.confListToDict( parent_list[(n+2):] )
267                    new_dict[ c ].append( temp_new_dict )
268
269                if parent_list[(n+1)] == '=' and (n+2) <= (len( parent_list )-1):
270
271                    if not new_dict.has_key( c ):
272                        new_dict[ c ] = [ ]
273
274                    new_dict[ c ].append( parent_list[ (n+2) ] )
275
276                    skip = 2
277
278                if parent_list[n] == '}':
279
280                    #print 'leaving confListToDict(): new dict = %s' %new_dict
281                    return (new_dict, count)
282
283    def makeConfDict( self ):
284
285        """
286        Walks through self.conf_list and creates a dictionary based upon config values
287
288        i.e.:
289            'tcp_accept_channel': [{'acl': [{'access': [{'action': ['"allow"'],
290                                                         'ip': ['"127.0.0.1"'],
291                                                         'mask': ['32']}]}],
292                                    'port': ['8649']}],
293            'udp_recv_channel': [{'port': ['8649']}],
294            'udp_send_channel': [{'host': ['145.101.32.3'],
295                                  'port': ['8649']},
296                                 {'host': ['145.101.32.207'],
297                                  'port': ['8649']}]}
298        """
299
300        new_dict = { }
301        skip     = 0
302
303        #print 'entering makeConfDict()'
304
305        for n, c in enumerate( self.conf_lijst ):
306
307            #print 'M: n %d c %s' %(n, c)
308
309            if skip > 0:
310
311                #print '- skipped'
312                skip = skip - 1
313                continue
314
315            if (n+1) <= (len( self.conf_lijst )-1):
316
317                if self.conf_lijst[(n+1)] == '{':
318
319                    if not new_dict.has_key( c ):
320                        new_dict[ c ] = [ ]
321
322                    ( temp_new_dict, skip ) = self.confListToDict( self.conf_lijst[(n+2):] )
323                    new_dict[ c ].append( temp_new_dict )
324
325                if self.conf_lijst[(n+1)] == '=' and (n+2) <= (len( self.conf_lijst )-1):
326
327                    if not new_dict.has_key( c ):
328                        new_dict[ c ] = [ ]
329
330                    new_dict[ c ].append( self.conf_lijst[ (n+2) ] )
331
332                    skip = 2
333
334        self.conf_dict = new_dict
335        #print 'leaving makeConfDict(): conf dict size %d' %len( self.conf_dict )
336
337    def checkConfDict( self ):
338
339        if len( self.conf_lijst ) == 0:
340
341            raise Exception("Something went wrong generating conf list for %s" %self.file_name )
342
343        if len( self.conf_dict ) == 0:
344
345            self.makeConfDict()
346
347    def getConfDict( self ):
348
349        self.checkConfDict()
350        return self.conf_dict
351
352    def getUdpSendChannels( self ):
353
354        self.checkConfDict()
355
356        udp_send_channels = [ ] # IP:PORT
357
358        if not self.conf_dict.has_key( 'udp_send_channel' ):
359            return None
360
361        for u in self.conf_dict[ 'udp_send_channel' ]:
362
363            if u.has_key( 'mcast_join' ):
364
365                ip = u['mcast_join'][0]
366
367            elif u.has_key( 'host' ):
368
369                ip = u['host'][0]
370
371            port = u['port'][0]
372
373            udp_send_channels.append( ( ip, port ) )
374
375        if len( udp_send_channels ) == 0:
376            return None
377
378        return udp_send_channels
379
380    def getSectionLastOption( self, section, option ):
381
382        """
383        Get last option set in a config section that could be set multiple times in multiple (include) files.
384
385        i.e.: getSectionLastOption( 'globals', 'send_metadata_interval' )
386        """
387
388        self.checkConfDict()
389        value = None
390
391        if not self.conf_dict.has_key( section ):
392
393            return None
394
395        # Could be set multiple times in multiple (include) files: get last one set
396        for c in self.conf_dict[ section ]:
397
398                if c.has_key( option ):
399
400                    value = c[ option ][0]
401
402        return value
403
404    def getClusterName( self ):
405
406        return self.getSectionLastOption( 'cluster', 'name' )
407
408    def getVal( self, section, option ):
409
410        return self.getSectionLastOption( section, option )
411
412    def getInt( self, section, valname ):
413
414        value    = self.getVal( section, valname )
415
416        if not value:
417            return None
418
419        return int( value )
420
421    def getStr( self, section, valname ):
422
423        value    = self.getVal( section, valname )
424
425        if not value:
426            return None
427
428        return str( value )
429
430def findGmetric():
431
432    for dir in os.path.expandvars( '$PATH' ).split( ':' ):
433
434        guess    = '%s/%s' %( dir, 'gmetric' )
435
436        if os.path.exists( guess ):
437
438            return guess
439
440    return False
441
442def loadConfig( filename ):
443
444    def getlist( cfg_string ):
445
446        my_list = [ ]
447
448        for item_txt in cfg_string.split( ',' ):
449
450            sep_char = None
451
452            item_txt = item_txt.strip()
453
454            for s_char in [ "'", '"' ]:
455
456                if item_txt.find( s_char ) != -1:
457
458                    if item_txt.count( s_char ) != 2:
459
460                        print 'Missing quote: %s' %item_txt
461                        sys.exit( 1 )
462
463                    else:
464
465                        sep_char = s_char
466                        break
467
468            if sep_char:
469
470                item_txt = item_txt.split( sep_char )[1]
471
472            my_list.append( item_txt )
473
474        return my_list
475
476    if not os.path.isfile( JOBMOND_CONF ):
477
478        print "Is not a file or does not exist: '%s'" %JOBMOND_CONF
479        sys.exit( 1 )
480
481    try:
482        f = open( JOBMOND_CONF, 'r' )
483    except IOError, detail:
484        print "Cannot read config file: '%s'" %JOBMOND_CONF
485        sys.exit( 1 )
486    else:
487        f.close()
488
489    cfg        = ConfigParser.ConfigParser()
490
491    cfg.read( filename )
492
493    global DEBUG_LEVEL, DAEMONIZE, BATCH_SERVER, BATCH_POLL_INTERVAL
494    global GMOND_CONF, DETECT_TIME_DIFFS, BATCH_HOST_TRANSLATE
495    global BATCH_API, QUEUE, GMETRIC_TARGET, USE_SYSLOG
496    global SYSLOG_LEVEL, SYSLOG_FACILITY, GMETRIC_BINARY
497    global METRIC_MAX_VAL_LEN, GMOND_UDP_SEND_CHANNELS
498
499    DEBUG_LEVEL = cfg.getint( 'DEFAULT', 'DEBUG_LEVEL' )
500
501    DAEMONIZE   = cfg.getboolean( 'DEFAULT', 'DAEMONIZE' )
502
503    SYSLOG_LEVEL    = -1
504    SYSLOG_FACILITY = None
505
506    try:
507        USE_SYSLOG  = cfg.getboolean( 'DEFAULT', 'USE_SYSLOG' )
508
509    except ConfigParser.NoOptionError:
510
511        USE_SYSLOG  = True
512
513        debug_msg( 0, 'ERROR: no option USE_SYSLOG found: assuming yes' )
514
515    if USE_SYSLOG:
516
517        try:
518            SYSLOG_LEVEL = cfg.getint( 'DEFAULT', 'SYSLOG_LEVEL' )
519
520        except ConfigParser.NoOptionError:
521
522            debug_msg( 0, 'ERROR: no option SYSLOG_LEVEL found: assuming level 0' )
523            SYSLOG_LEVEL = 0
524
525        try:
526
527            SYSLOG_FACILITY = eval( 'syslog.LOG_' + cfg.get( 'DEFAULT', 'SYSLOG_FACILITY' ) )
528
529        except ConfigParser.NoOptionError:
530
531            SYSLOG_FACILITY = syslog.LOG_DAEMON
532
533            debug_msg( 0, 'ERROR: no option SYSLOG_FACILITY found: assuming facility DAEMON' )
534
535    try:
536
537        BATCH_SERVER = cfg.get( 'DEFAULT', 'BATCH_SERVER' )
538
539    except ConfigParser.NoOptionError:
540
541        # Backwards compatibility for old configs
542        #
543
544        BATCH_SERVER = cfg.get( 'DEFAULT', 'TORQUE_SERVER' )
545        api_guess    = 'pbs'
546   
547    try:
548   
549        BATCH_POLL_INTERVAL = cfg.getint( 'DEFAULT', 'BATCH_POLL_INTERVAL' )
550
551    except ConfigParser.NoOptionError:
552
553        # Backwards compatibility for old configs
554        #
555
556        BATCH_POLL_INTERVAL = cfg.getint( 'DEFAULT', 'TORQUE_POLL_INTERVAL' )
557        api_guess           = 'pbs'
558   
559    try:
560
561        GMOND_CONF          = cfg.get( 'DEFAULT', 'GMOND_CONF' )
562
563    except ConfigParser.NoOptionError:
564
565        # Not specified: assume /etc/ganglia/gmond.conf
566        #
567        GMOND_CONF          = '/etc/ganglia/gmond.conf'
568
569    ganglia_cfg             = GangliaConfigParser( GMOND_CONF )
570    GMETRIC_TARGET          = None
571
572    GMOND_UDP_SEND_CHANNELS = ganglia_cfg.getUdpSendChannels()
573
574    if not GMOND_UDP_SEND_CHANNELS:
575
576        debug_msg( 0, "WARNING: Can't parse udp_send_channel from: '%s' - Trying: %s" %( GMOND_CONF, JOBMOND_CONF ) )
577
578        # Couldn't figure it out: let's see if it's in our jobmond.conf
579        #
580        try:
581
582            GMETRIC_TARGET    = cfg.get( 'DEFAULT', 'GMETRIC_TARGET' )
583
584        # Guess not: now just give up
585       
586        except ConfigParser.NoOptionError:
587
588            GMETRIC_TARGET    = None
589
590            debug_msg( 0, "ERROR: GMETRIC_TARGET not set: internal Gmetric handling aborted. Failing back to DEPRECATED use of gmond.conf/gmetric binary. This will slow down jobmond significantly!" )
591
592            gmetric_bin    = findGmetric()
593
594            if gmetric_bin:
595
596                GMETRIC_BINARY     = gmetric_bin
597            else:
598                debug_msg( 0, "WARNING: Can't find gmetric binary anywhere in $PATH" )
599
600                try:
601
602                    GMETRIC_BINARY = cfg.get( 'DEFAULT', 'GMETRIC_BINARY' )
603
604                except ConfigParser.NoOptionError:
605
606                    print "FATAL ERROR: GMETRIC_BINARY not set and not in $PATH"
607                    sys.exit( 1 )
608
609    #TODO: is this really still needed or should be automatic
610    DETECT_TIME_DIFFS    = cfg.getboolean( 'DEFAULT', 'DETECT_TIME_DIFFS' )
611
612    BATCH_HOST_TRANSLATE = getlist( cfg.get( 'DEFAULT', 'BATCH_HOST_TRANSLATE' ) )
613
614    try:
615
616        BATCH_API    = cfg.get( 'DEFAULT', 'BATCH_API' )
617
618    except ConfigParser.NoOptionError, detail:
619
620        if BATCH_SERVER and api_guess:
621
622            BATCH_API    = api_guess
623        else:
624            print "FATAL ERROR: BATCH_API not set and can't make guess"
625            sys.exit( 1 )
626
627    try:
628
629        QUEUE        = getlist( cfg.get( 'DEFAULT', 'QUEUE' ) )
630
631    except ConfigParser.NoOptionError, detail:
632
633        QUEUE        = None
634
635    METRIC_MAX_VAL_LEN = ganglia_cfg.getInt( 'globals', 'max_udp_msg_len' )
636
637    return True
638
639def fqdn_parts (fqdn):
640
641    """Return pair of host and domain for fully-qualified domain name arg."""
642
643    parts = fqdn.split (".")
644
645    return (parts[0], string.join(parts[1:], "."))
646
647class DataProcessor:
648
649    """Class for processing of data"""
650
651    binary = None
652
653    def __init__( self, binary=None ):
654
655        """Remember alternate binary location if supplied"""
656
657        global GMETRIC_BINARY, GMOND_CONF
658
659        if binary:
660            self.binary = binary
661
662        if not self.binary and not GMETRIC_TARGET and not GMOND_UDP_SEND_CHANNELS:
663            self.binary = GMETRIC_BINARY
664
665        # Timeout for XML
666        #
667        # From ganglia's documentation:
668        #
669        # 'A metric will be deleted DMAX seconds after it is received, and
670        # DMAX=0 means eternal life.'
671
672        self.dmax = str( int( int( BATCH_POLL_INTERVAL ) * 2 ) )
673
674        if GMOND_CONF and not GMETRIC_TARGET and not GMOND_UDP_SEND_CHANNELS:
675
676            incompatible = self.checkGmetricVersion()
677
678            if incompatible:
679
680                print 'Ganglia/Gmetric version not compatible, please upgrade to at least 3.4.0'
681                sys.exit( 1 )
682
683    def checkGmetricVersion( self ):
684
685        """
686        Check version of gmetric is at least 3.4.0
687        for the syntax we use
688        """
689
690        global METRIC_MAX_VAL_LEN, GMETRIC_TARGET
691
692        incompatible    = 0
693
694        gfp        = os.popen( self.binary + ' --version' )
695        lines      = gfp.readlines()
696
697        gfp.close()
698
699        for line in lines:
700
701            line = line.split( ' ' )
702
703            if len( line ) == 2 and str( line ).find( 'gmetric' ) != -1:
704           
705                gmetric_version    = line[1].split( '\n' )[0]
706
707                version_major    = int( gmetric_version.split( '.' )[0] )
708                version_minor    = int( gmetric_version.split( '.' )[1] )
709                version_patch    = int( gmetric_version.split( '.' )[2] )
710
711                incompatible    = 0
712
713                if version_major < 3:
714
715                    incompatible = 1
716               
717                elif version_major == 3:
718
719                    if version_minor < 4:
720
721                        incompatible = 1
722
723        return incompatible
724
725    def multicastGmetric( self, metricname, metricval, valtype='string', units='' ):
726
727        """Call gmetric binary and multicast"""
728
729        cmd = self.binary
730
731        if GMOND_UDP_SEND_CHANNELS:
732
733            for c_ip, c_port  in GMOND_UDP_SEND_CHANNELS:
734
735                metric_debug        = "[gmetric %s:%s] name: %s - val: %s - dmax: %s" %( str(c_ip), str(c_port), str( metricname ), str( metricval ), str( self.dmax ) )
736
737                debug_msg( 10, printTime() + ' ' + metric_debug)
738
739                gm = Gmetric( c_ip, c_port )
740
741                gm.send( str( metricname ), str( metricval ), str( self.dmax ), valtype, units )
742
743        elif GMETRIC_TARGET:
744
745            GMETRIC_TARGET_HOST    = GMETRIC_TARGET.split( ':' )[0]
746            GMETRIC_TARGET_PORT    = GMETRIC_TARGET.split( ':' )[1]
747
748            metric_debug        = "[gmetric] name: %s - val: %s - dmax: %s" %( str( metricname ), str( metricval ), str( self.dmax ) )
749
750            debug_msg( 10, printTime() + ' ' + metric_debug)
751
752            gm = Gmetric( GMETRIC_TARGET_HOST, GMETRIC_TARGET_PORT )
753
754            gm.send( str( metricname ), str( metricval ), str( self.dmax ), valtype, units )
755
756        else:
757            try:
758                cmd = cmd + ' -c' + GMOND_CONF
759
760            except NameError:
761
762                debug_msg( 10, 'Assuming /etc/ganglia/gmond.conf for gmetric cmd' )
763
764            cmd = cmd + ' -n' + str( metricname )+ ' -v"' + str( metricval )+ '" -t' + str( valtype ) + ' -d' + str( self.dmax )
765
766            if len( units ) > 0:
767
768                cmd = cmd + ' -u"' + units + '"'
769
770            debug_msg( 10, printTime() + ' ' + cmd )
771
772            os.system( cmd )
773
774class DataGatherer:
775
776    """Skeleton class for batch system DataGatherer"""
777
778    def printJobs( self, jobs ):
779
780        """Print a jobinfo overview"""
781
782        for name, attrs in self.jobs.items():
783
784            print 'job %s' %(name)
785
786            for name, val in attrs.items():
787
788                print '\t%s = %s' %( name, val )
789
790    def printJob( self, jobs, job_id ):
791
792        """Print job with job_id from jobs"""
793
794        print 'job %s' %(job_id)
795
796        for name, val in jobs[ job_id ].items():
797
798            print '\t%s = %s' %( name, val )
799
800    def getAttr( self, attrs, name ):
801
802        """Return certain attribute from dictionary, if exists"""
803
804        if attrs.has_key( name ):
805
806            return attrs[ name ]
807        else:
808            return ''
809
810    def jobDataChanged( self, jobs, job_id, attrs ):
811
812        """Check if job with attrs and job_id in jobs has changed"""
813
814        if jobs.has_key( job_id ):
815
816            oldData = jobs[ job_id ]   
817        else:
818            return 1
819
820        for name, val in attrs.items():
821
822            if oldData.has_key( name ):
823
824                if oldData[ name ] != attrs[ name ]:
825
826                    return 1
827
828            else:
829                return 1
830
831        return 0
832
833    def submitJobData( self ):
834
835        """Submit job info list"""
836
837        global BATCH_API
838
839        self.dp.multicastGmetric( 'zplugin_monarch_heartbeat', str( int( int( self.cur_time ) + int( self.timeoffset ) ) ) )
840
841        running_jobs = 0
842        queued_jobs  = 0
843
844        # Count how many running/queued jobs we found
845        #
846        for jobid, jobattrs in self.jobs.items():
847
848            if jobattrs[ 'status' ] == 'Q':
849
850                queued_jobs += 1
851
852            elif jobattrs[ 'status' ] == 'R':
853
854                running_jobs += 1
855
856        # Report running/queued jobs as seperate metric for a nice RRD graph
857        #
858        self.dp.multicastGmetric( 'zplugin_monarch_rj', str( running_jobs ), 'uint32', 'jobs' )
859        self.dp.multicastGmetric( 'zplugin_monarch_qj', str( queued_jobs ), 'uint32', 'jobs' )
860
861        # Report down/offline nodes in batch (PBS only ATM)
862        #
863        if BATCH_API == 'pbs':
864
865            domain        = fqdn_parts( socket.getfqdn() )[1]
866
867            downed_nodes  = list()
868            offline_nodes = list()
869       
870            l        = ['state']
871       
872            # TODO catch PBSError: like pq.getJobData
873            for name, node in self.pq.getnodes().items():
874
875                if ( node[ 'state' ].find( "down" ) != -1 ):
876
877                    downed_nodes.append( name )
878
879                if ( node[ 'state' ].find( "offline" ) != -1 ):
880
881                    offline_nodes.append( name )
882
883            downnodeslist    = do_nodelist( downed_nodes )
884            offlinenodeslist = do_nodelist( offline_nodes )
885
886            down_str    = 'nodes=%s domain=%s reported=%s' %( string.join( downnodeslist, ';' ), domain, str( int( int( self.cur_time ) + int( self.timeoffset ) ) ) )
887            offl_str    = 'nodes=%s domain=%s reported=%s' %( string.join( offlinenodeslist, ';' ), domain, str( int( int( self.cur_time ) + int( self.timeoffset ) ) ) )
888            self.dp.multicastGmetric( 'zplugin_monarch_down'   , down_str )
889            self.dp.multicastGmetric( 'zplugin_monarch_offline', offl_str )
890
891        # Now let's spread the knowledge
892        #
893        for jobid, jobattrs in self.jobs.items():
894
895            # Make gmetric values for each job: respect max gmetric value length
896            #
897            gmetric_val        = self.compileGmetricVal( jobid, jobattrs )
898            metric_increment    = 0
899
900            # If we have more job info than max gmetric value length allows, split it up
901            # amongst multiple metrics
902            #
903            for val in gmetric_val:
904
905                metric_name = 'zplugin_monarch_job_%s_%s' %( str(metric_increment) , str( jobid ) )
906                self.dp.multicastGmetric( metric_name, val )
907
908                # Increase follow number if this jobinfo is split up amongst more than 1 gmetric
909                #
910                metric_increment    = metric_increment + 1
911
912    def compileGmetricVal( self, jobid, jobattrs ):
913
914        """Create a val string for gmetric of jobinfo"""
915
916        gval_lists    = [ ]
917        val_list    = { }
918
919        for val_name, val_value in jobattrs.items():
920
921            # These are our own metric names, i.e.: status, start_timestamp, etc
922            #
923            val_list_names_len    = len( string.join( val_list.keys() ) ) + len(val_list.keys())
924
925            # These are their corresponding values
926            #
927            val_list_vals_len    = len( string.join( val_list.values() ) ) + len(val_list.values())
928
929            if val_name == 'nodes' and jobattrs['status'] == 'R':
930
931                node_str = None
932
933                for node in val_value:
934
935                    if node_str:
936
937                        node_str = node_str + ';' + node
938                    else:
939                        node_str = node
940
941                    # Make sure if we add this new info, that the total metric's value length does not exceed METRIC_MAX_VAL_LEN
942                    #
943                    if (val_list_names_len + len(val_name) ) + (val_list_vals_len + len(node_str) ) > METRIC_MAX_VAL_LEN:
944
945                        # It's too big, we need to make a new gmetric for the additional info
946                        #
947                        val_list[ val_name ]    = node_str
948
949                        gval_lists.append( val_list )
950
951                        val_list        = { }
952                        node_str        = None
953
954                val_list[ val_name ]    = node_str
955
956                gval_lists.append( val_list )
957
958                val_list        = { }
959
960            elif val_value != '':
961
962                # Make sure if we add this new info, that the total metric's value length does not exceed METRIC_MAX_VAL_LEN
963                #
964                if (val_list_names_len + len(val_name) ) + (val_list_vals_len + len(str(val_value)) ) > METRIC_MAX_VAL_LEN:
965
966                    # It's too big, we need to make a new gmetric for the additional info
967                    #
968                    gval_lists.append( val_list )
969
970                    val_list        = { }
971
972                val_list[ val_name ]    = val_value
973
974        if len( val_list ) > 0:
975
976            gval_lists.append( val_list )
977
978        str_list    = [ ]
979
980        # Now append the value names and values together, i.e.: stop_timestamp=value, etc
981        #
982        for val_list in gval_lists:
983
984            my_val_str    = None
985
986            for val_name, val_value in val_list.items():
987
988                if type(val_value) == list:
989
990                    val_value    = val_value.join( ',' )
991
992                if my_val_str:
993
994                    try:
995                        # fixme: It's getting
996                        # ('nodes', None) items
997                        my_val_str = my_val_str + ' ' + val_name + '=' + val_value
998                    except:
999                        pass
1000
1001                else:
1002                    my_val_str = val_name + '=' + val_value
1003
1004            str_list.append( my_val_str )
1005
1006        return str_list
1007
1008    def daemon( self ):
1009
1010        """Run as daemon forever"""
1011
1012        # Fork the first child
1013        #
1014        pid = os.fork()
1015        if pid > 0:
1016            sys.exit(0)  # end parent
1017
1018        # creates a session and sets the process group ID
1019        #
1020        os.setsid()
1021
1022        # Fork the second child
1023        #
1024        pid = os.fork()
1025        if pid > 0:
1026            sys.exit(0)  # end parent
1027
1028        write_pidfile()
1029
1030        # Go to the root directory and set the umask
1031        #
1032        os.chdir('/')
1033        os.umask(0)
1034
1035        sys.stdin.close()
1036        sys.stdout.close()
1037        sys.stderr.close()
1038
1039        os.open('/dev/null', os.O_RDWR)
1040        os.dup2(0, 1)
1041        os.dup2(0, 2)
1042
1043        self.run()
1044
1045    def run( self ):
1046
1047        """Main thread"""
1048
1049        while ( 1 ):
1050       
1051            self.getJobData()
1052            self.submitJobData()
1053            time.sleep( BATCH_POLL_INTERVAL )   
1054
1055# SGE code by Dave Love <fx@gnu.org>.  Tested with SGE 6.0u8 and 6.0u11.  May
1056# work with SGE 6.1 (else should be easily fixable), but definitely doesn't
1057# with 6.2.  See also the fixmes.
1058
1059class NoJobs (Exception):
1060    """Exception raised by empty job list in qstat output."""
1061    pass
1062
1063class SgeQstatXMLParser(xml.sax.handler.ContentHandler):
1064    """SAX handler for XML output from Sun Grid Engine's `qstat'."""
1065
1066    def __init__(self):
1067        self.value = ""
1068        self.joblist = []
1069        self.job = {}
1070        self.queue = ""
1071        self.in_joblist = False
1072        self.lrequest = False
1073        self.eltq = deque()
1074        xml.sax.handler.ContentHandler.__init__(self)
1075
1076    # The structure of the output is as follows (for SGE 6.0).  It's
1077    # similar for 6.1, but radically different for 6.2, and is
1078    # undocumented generally.  Unfortunately it's voluminous, and probably
1079    # doesn't scale to large clusters/queues.
1080
1081    # <detailed_job_info  xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema">
1082    #   <djob_info>
1083    #     <qmaster_response>  <!-- job -->
1084    #       ...
1085    #       <JB_ja_template> 
1086    #     <ulong_sublist>
1087    #     ...         <!-- start_time, state ... -->
1088    #     </ulong_sublist>
1089    #       </JB_ja_template> 
1090    #       <JB_ja_tasks>
1091    #     <ulong_sublist>
1092    #       ...       <!-- task info
1093    #     </ulong_sublist>
1094    #     ...
1095    #       </JB_ja_tasks>
1096    #       ...
1097    #     </qmaster_response>
1098    #   </djob_info>
1099    #   <messages>
1100    #   ...
1101
1102    # NB.  We might treat each task as a separate job, like
1103    # straight qstat output, but the web interface expects jobs to
1104    # be identified by integers, not, say, <job number>.<task>.
1105
1106    # So, I lied.  If the job list is empty, we get invalid XML
1107    # like this, which we need to defend against:
1108
1109    # <unknown_jobs  xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema">
1110    #   <>
1111    #     <ST_name>*</ST_name>
1112    #   </>
1113    # </unknown_jobs>
1114
1115    def startElement(self, name, attrs):
1116        self.value = ""
1117        if name == "djob_info":    # job list
1118            self.in_joblist = True
1119        # The job container is "qmaster_response" in SGE 6.0
1120        # and 6.1, but "element" in 6.2.  This is only the very
1121        # start of what's necessary for 6.2, though (sigh).
1122        elif (name == "qmaster_response" or name == "element") \
1123                and self.eltq[-1] == "djob_info": # job
1124            self.job = {"job_state": "U", "slots": 0,
1125                    "nodes": [], "queued_timestamp": "",
1126                    "queued_timestamp": "", "queue": "",
1127                    "ppn": "0", "RN_max": 0,
1128                    # fixme in endElement
1129                    "requested_memory": 0, "requested_time": 0
1130                    }
1131            self.joblist.append(self.job)
1132        elif name == "qstat_l_requests": # resource request
1133            self.lrequest = True
1134        elif name == "unknown_jobs":
1135            raise NoJobs
1136        self.eltq.append (name)
1137
1138    def characters(self, ch):
1139        self.value += ch
1140
1141    def endElement(self, name): 
1142        """Snarf job elements contents into job dictionary.
1143           Translate keys if appropriate."""
1144
1145        name_trans = {
1146          "JB_job_number": "number",
1147          "JB_job_name": "name", "JB_owner": "owner",
1148          "queue_name": "queue", "JAT_start_time": "start_timestamp",
1149          "JB_submission_time": "queued_timestamp"
1150          }
1151        value = self.value
1152        self.eltq.pop ()
1153
1154        if name == "djob_info":
1155            self.in_joblist = False
1156            self.job = {}
1157        elif name == "JAT_master_queue":
1158            self.job["queue"] = value.split("@")[0]
1159        elif name == "JG_qhostname":
1160            if not (value in self.job["nodes"]):
1161                self.job["nodes"].append(value)
1162        elif name == "JG_slots": # slots in use
1163            self.job["slots"] += int(value)
1164        elif name == "RN_max": # requested slots (tasks or parallel)
1165            self.job["RN_max"] = max (self.job["RN_max"],
1166                          int(value))
1167        elif name == "JAT_state": # job state (bitwise or)
1168            value = int (value)
1169            # Status values from sge_jobL.h
1170            #define JIDLE           0x00000000
1171            #define JHELD           0x00000010
1172            #define JMIGRATING          0x00000020
1173            #define JQUEUED         0x00000040
1174            #define JRUNNING        0x00000080
1175            #define JSUSPENDED          0x00000100
1176            #define JTRANSFERING        0x00000200
1177            #define JDELETED        0x00000400
1178            #define JWAITING        0x00000800
1179            #define JEXITING        0x00001000
1180            #define JWRITTEN        0x00002000
1181            #define JSUSPENDED_ON_THRESHOLD 0x00010000
1182            #define JFINISHED           0x00010000
1183            if value & 0x80:
1184                self.job["status"] = "R"
1185            elif value & 0x40:
1186                self.job["status"] = "Q"
1187            else:
1188                self.job["status"] = "O" # `other'
1189        elif name == "CE_name" and self.lrequest and self.value in \
1190                ("h_cpu", "s_cpu", "cpu", "h_core", "s_core"):
1191            # We're in a container for an interesting resource
1192            # request; record which type.
1193            self.lrequest = self.value
1194        elif name == "CE_doubleval" and self.lrequest:
1195            # if we're in a container for an interesting
1196            # resource request, use the maxmimum of the hard
1197            # and soft requests to record the requested CPU
1198            # or core.  Fixme:  I'm not sure if this logic is
1199            # right.
1200            if self.lrequest in ("h_core", "s_core"):
1201                self.job["requested_memory"] = \
1202                    max (float (value),
1203                     self.job["requested_memory"])
1204            # Fixme:  Check what cpu means, c.f [hs]_cpu.
1205            elif self.lrequest in ("h_cpu", "s_cpu", "cpu"):
1206                self.job["requested_time"] = \
1207                    max (float (value),
1208                     self.job["requested_time"])
1209        elif name == "qstat_l_requests":
1210            self.lrequest = False
1211        elif self.job and self.in_joblist:
1212            if name in name_trans:
1213                name = name_trans[name]
1214                self.job[name] = value
1215
1216# Abstracted from PBS original.
1217# Fixme:  Is it worth (or appropriate for PBS) sorting the result?
1218#
1219def do_nodelist( nodes ):
1220
1221    """Translate node list as appropriate."""
1222
1223    nodeslist        = [ ]
1224    my_domain        = fqdn_parts( socket.getfqdn() )[1]
1225
1226    for node in nodes:
1227
1228        host        = node.split( '/' )[0] # not relevant for SGE
1229        h, host_domain    = fqdn_parts(host)
1230
1231        if host_domain == my_domain:
1232
1233            host    = h
1234
1235        if nodeslist.count( host ) == 0:
1236
1237            for translate_pattern in BATCH_HOST_TRANSLATE:
1238
1239                if translate_pattern.find( '/' ) != -1:
1240
1241                    translate_orig    = \
1242                        translate_pattern.split( '/' )[1]
1243                    translate_new    = \
1244                        translate_pattern.split( '/' )[2]
1245                    host = re.sub( translate_orig,
1246                               translate_new, host )
1247            if not host in nodeslist:
1248                nodeslist.append( host )
1249    return nodeslist
1250
1251class SgeDataGatherer(DataGatherer):
1252
1253    jobs = {}
1254
1255    def __init__( self ):
1256        self.jobs = {}
1257        self.timeoffset = 0
1258        self.dp = DataProcessor()
1259
1260    def getJobData( self ):
1261        """Gather all data on current jobs in SGE"""
1262
1263        import popen2
1264
1265        self.cur_time = 0
1266        queues = ""
1267        if QUEUE:    # only for specific queues
1268            # Fixme:  assumes queue names don't contain single
1269            # quote or comma.  Don't know what the SGE rules are.
1270            queues = " -q '" + string.join (QUEUE, ",") + "'"
1271        # Note the comment in SgeQstatXMLParser about scaling with
1272        # this method of getting data.  I haven't found better one.
1273        # Output with args `-xml -ext -f -r' is easier to parse
1274        # in some ways, harder in others, but it doesn't provide
1275        # the submission time (at least SGE 6.0).  The pipeline
1276        # into sed corrects bogus XML observed with a configuration
1277        # of SGE 6.0u8, which otherwise causes the parsing to hang.
1278        piping = popen2.Popen3("qstat -u '*' -j '*' -xml | \
1279sed -e 's/reported usage>/reported_usage>/g' -e 's;<\/*JATASK:.*>;;'" \
1280                           + queues, True)
1281        qstatparser = SgeQstatXMLParser()
1282        parse_err = 0
1283        try:
1284            xml.sax.parse(piping.fromchild, qstatparser)
1285        except NoJobs:
1286            pass
1287        except:
1288            parse_err = 1
1289        if piping.wait():
1290            debug_msg(10, "qstat error, skipping until next polling interval: " + piping.childerr.readline())
1291            return None
1292        elif parse_err:
1293            debug_msg(10, "Bad XML output from qstat"())
1294            exit (1)
1295        for f in piping.fromchild, piping.tochild, piping.childerr:
1296            f.close()
1297        self.cur_time = time.time()
1298        jobs_processed = []
1299        for job in qstatparser.joblist:
1300            job_id = job["number"]
1301            if job["status"] in [ 'Q', 'R' ]:
1302                jobs_processed.append(job_id)
1303            if job["status"] == "R":
1304                job["nodes"] = do_nodelist (job["nodes"])
1305                # Fixme: why is job["nodes"] sometimes null?
1306                try:
1307                    # Fixme: Is this sensible?  The
1308                    # PBS-type PPN isn't something you use
1309                    # with SGE.
1310                    job["ppn"] = float(job["slots"]) / len(job["nodes"])
1311                except:
1312                    job["ppn"] = 0
1313                if DETECT_TIME_DIFFS:
1314                    # If a job start is later than our
1315                    # current date, that must mean
1316                    # the SGE server's time is later
1317                    # than our local time.
1318                    start_timestamp = int (job["start_timestamp"])
1319                    if start_timestamp > int(self.cur_time) + int(self.timeoffset):
1320
1321                        self.timeoffset    = start_timestamp - int(self.cur_time)
1322            else:
1323                # fixme: Note sure what this should be:
1324                job["ppn"] = job["RN_max"]
1325                job["nodes"] = "1"
1326
1327            myAttrs = {}
1328            for attr in ["name", "queue", "owner",
1329                     "requested_time", "status",
1330                     "requested_memory", "ppn",
1331                     "start_timestamp", "queued_timestamp"]:
1332                myAttrs[attr] = str(job[attr])
1333            myAttrs["nodes"] = job["nodes"]
1334            myAttrs["reported"] = str(int(self.cur_time) + int(self.timeoffset))
1335            myAttrs["domain"] = fqdn_parts(socket.getfqdn())[1]
1336            myAttrs["poll_interval"] = str(BATCH_POLL_INTERVAL)
1337
1338            if self.jobDataChanged(self.jobs, job_id, myAttrs) and myAttrs["status"] in ["R", "Q"]:
1339                self.jobs[job_id] = myAttrs
1340        for id, attrs in self.jobs.items():
1341            if id not in jobs_processed:
1342                del self.jobs[id]
1343
1344# LSF code by Mahmoud Hanafi <hanafim@users.sourceforge.nt>
1345# Requres LSFObject http://sourceforge.net/projects/lsfobject
1346#
1347class LsfDataGatherer(DataGatherer):
1348
1349    """This is the DataGatherer for LSf"""
1350
1351    global lsfObject
1352
1353    def __init__( self ):
1354
1355        self.jobs = { }
1356        self.timeoffset = 0
1357        self.dp = DataProcessor()
1358        self.initLsfQuery()
1359
1360    def _countDuplicatesInList( self, dupedList ):
1361
1362        countDupes    = { }
1363
1364        for item in dupedList:
1365
1366            if not countDupes.has_key( item ):
1367
1368                countDupes[ item ]    = 1
1369            else:
1370                countDupes[ item ]    = countDupes[ item ] + 1
1371
1372        dupeCountList    = [ ]
1373
1374        for item, count in countDupes.items():
1375
1376            dupeCountList.append( ( item, count ) )
1377
1378        return dupeCountList
1379#
1380#lst = ['I1','I2','I1','I3','I4','I4','I7','I7','I7','I7','I7']
1381#print _countDuplicatesInList(lst)
1382#[('I1', 2), ('I3', 1), ('I2', 1), ('I4', 2), ('I7', 5)]
1383########################
1384
1385    def initLsfQuery( self ):
1386        self.pq = None
1387        self.pq = lsfObject.jobInfoEntObject()
1388
1389    def getJobData( self, known_jobs="" ):
1390        """Gather all data on current jobs in LSF"""
1391        if len( known_jobs ) > 0:
1392            jobs = known_jobs
1393        else:
1394            jobs = { }
1395        joblist = {}
1396        joblist = self.pq.getJobInfo()
1397        nodelist = ''
1398
1399        self.cur_time = time.time()
1400
1401        jobs_processed = [ ]
1402
1403        for name, attrs in joblist.items():
1404            job_id = str(name)
1405            jobs_processed.append( job_id )
1406            name = self.getAttr( attrs, 'jobName' )
1407            queue = self.getAttr( self.getAttr( attrs, 'submit') , 'queue' )
1408            owner = self.getAttr( attrs, 'user' )
1409
1410### THIS IS THE rLimit List index values
1411#define LSF_RLIMIT_CPU      0        /* cpu time in milliseconds */
1412#define LSF_RLIMIT_FSIZE    1        /* maximum file size */
1413#define LSF_RLIMIT_DATA     2        /* data size */
1414#define LSF_RLIMIT_STACK    3        /* stack size */
1415#define LSF_RLIMIT_CORE     4        /* core file size */
1416#define LSF_RLIMIT_RSS      5        /* resident set size */
1417#define LSF_RLIMIT_NOFILE   6        /* open files */
1418#define LSF_RLIMIT_OPEN_MAX 7        /* (from HP-UX) */
1419#define LSF_RLIMIT_VMEM     8        /* maximum swap mem */
1420#define LSF_RLIMIT_SWAP     8
1421#define LSF_RLIMIT_RUN      9        /* max wall-clock time limit */
1422#define LSF_RLIMIT_PROCESS  10       /* process number limit */
1423#define LSF_RLIMIT_THREAD   11       /* thread number limit (introduced in LSF6.0) */
1424#define LSF_RLIM_NLIMITS    12       /* number of resource limits */
1425
1426            requested_time = self.getAttr( self.getAttr( attrs, 'submit') , 'rLimits' )[9]
1427            if requested_time == -1: 
1428                requested_time = ""
1429            requested_memory = self.getAttr( self.getAttr( attrs, 'submit') , 'rLimits' )[8]
1430            if requested_memory == -1: 
1431                requested_memory = ""
1432# This tries to get proc per node. We don't support this right now
1433            ppn = 0 #self.getAttr( self.getAttr( attrs, 'SubmitList') , 'numProessors' )
1434            requested_cpus = self.getAttr( self.getAttr( attrs, 'submit') , 'numProcessors' )
1435            if requested_cpus == None or requested_cpus == "":
1436                requested_cpus = 1
1437
1438            if QUEUE:
1439                for q in QUEUE:
1440                    if q == queue:
1441                        display_queue = 1
1442                        break
1443                    else:
1444                        display_queue = 0
1445                        continue
1446            if display_queue == 0:
1447                continue
1448
1449            runState = self.getAttr( attrs, 'status' )
1450            if runState == 4:
1451                status = 'R'
1452            else:
1453                status = 'Q'
1454            queued_timestamp = self.getAttr( attrs, 'submitTime' )
1455
1456            if status == 'R':
1457                start_timestamp = self.getAttr( attrs, 'startTime' )
1458                nodesCpu =  dict(self._countDuplicatesInList(self.getAttr( attrs, 'exHosts' )))
1459                nodelist = nodesCpu.keys()
1460
1461                if DETECT_TIME_DIFFS:
1462
1463                    # If a job start if later than our current date,
1464                    # that must mean the Torque server's time is later
1465                    # than our local time.
1466
1467                    if int(start_timestamp) > int( int(self.cur_time) + int(self.timeoffset) ):
1468
1469                        self.timeoffset = int( int(start_timestamp) - int(self.cur_time) )
1470
1471            elif status == 'Q':
1472                start_timestamp = ''
1473                count_mynodes = 0
1474                numeric_node = 1
1475                nodelist = ''
1476
1477            myAttrs = { }
1478            if name == "":
1479                myAttrs['name'] = "none"
1480            else:
1481                myAttrs['name'] = name
1482
1483            myAttrs[ 'owner' ]        = owner
1484            myAttrs[ 'requested_time' ]    = str(requested_time)
1485            myAttrs[ 'requested_memory' ]    = str(requested_memory)
1486            myAttrs[ 'requested_cpus' ]    = str(requested_cpus)
1487            myAttrs[ 'ppn' ]        = str( ppn )
1488            myAttrs[ 'status' ]        = status
1489            myAttrs[ 'start_timestamp' ]    = str(start_timestamp)
1490            myAttrs[ 'queue' ]        = str(queue)
1491            myAttrs[ 'queued_timestamp' ]    = str(queued_timestamp)
1492            myAttrs[ 'reported' ]        = str( int( int( self.cur_time ) + int( self.timeoffset ) ) )
1493            myAttrs[ 'nodes' ]        = do_nodelist( nodelist )
1494            myAttrs[ 'domain' ]        = fqdn_parts( socket.getfqdn() )[1]
1495            myAttrs[ 'poll_interval' ]    = str(BATCH_POLL_INTERVAL)
1496
1497            if self.jobDataChanged( jobs, job_id, myAttrs ) and myAttrs['status'] in [ 'R', 'Q' ]:
1498                jobs[ job_id ] = myAttrs
1499
1500                debug_msg( 10, printTime() + ' job %s state changed' %(job_id) )
1501
1502        for id, attrs in jobs.items():
1503            if id not in jobs_processed:
1504                # This one isn't there anymore
1505                #
1506                del jobs[ id ]
1507        self.jobs=jobs
1508
1509
1510class PbsDataGatherer( DataGatherer ):
1511
1512    """This is the DataGatherer for PBS and Torque"""
1513
1514    global PBSQuery, PBSError
1515
1516    def __init__( self ):
1517
1518        """Setup appropriate variables"""
1519
1520        self.jobs       = { }
1521        self.timeoffset = 0
1522        self.dp         = DataProcessor()
1523
1524        self.initPbsQuery()
1525
1526    def initPbsQuery( self ):
1527
1528        self.pq = None
1529
1530        try:
1531
1532            if( BATCH_SERVER ):
1533
1534                self.pq = PBSQuery( BATCH_SERVER )
1535            else:
1536                self.pq = PBSQuery()
1537
1538        except PBSError, details:
1539            print 'Cannot connect to pbs server'
1540            print details
1541            sys.exit( 1 )
1542
1543        try:
1544            self.pq.old_data_structure()
1545
1546        except AttributeError:
1547
1548            # pbs_query is older
1549            #
1550            pass
1551
1552    def getJobData( self ):
1553
1554        """Gather all data on current jobs in Torque"""
1555
1556        joblist            = {}
1557        self.cur_time      = 0
1558
1559        try:
1560            joblist        = self.pq.getjobs()
1561            self.cur_time  = time.time()
1562
1563        except PBSError, detail:
1564
1565            debug_msg( 10, "Caught PBS unavailable, skipping until next polling interval: " + str( detail ) )
1566            return None
1567
1568        jobs_processed    = [ ]
1569
1570        for name, attrs in joblist.items():
1571            display_queue = 1
1572            job_id        = name.split( '.' )[0]
1573
1574            name          = self.getAttr( attrs, 'Job_Name' )
1575            queue         = self.getAttr( attrs, 'queue' )
1576
1577            if QUEUE:
1578                for q in QUEUE:
1579                    if q == queue:
1580                        display_queue = 1
1581                        break
1582                    else:
1583                        display_queue = 0
1584                        continue
1585            if display_queue == 0:
1586                continue
1587
1588
1589            owner            = self.getAttr( attrs, 'Job_Owner' ).split( '@' )[0]
1590            requested_time   = self.getAttr( attrs, 'Resource_List.walltime' )
1591            requested_memory = self.getAttr( attrs, 'Resource_List.mem' )
1592
1593            mynoderequest    = self.getAttr( attrs, 'Resource_List.nodes' )
1594
1595            ppn = ''
1596
1597            if mynoderequest.find( ':' ) != -1 and mynoderequest.find( 'ppn' ) != -1:
1598
1599                mynoderequest_fields = mynoderequest.split( ':' )
1600
1601                for mynoderequest_field in mynoderequest_fields:
1602
1603                    if mynoderequest_field.find( 'ppn' ) != -1:
1604
1605                        ppn = mynoderequest_field.split( 'ppn=' )[1]
1606
1607            status = self.getAttr( attrs, 'job_state' )
1608
1609            if status in [ 'Q', 'R' ]:
1610
1611                jobs_processed.append( job_id )
1612
1613            queued_timestamp = self.getAttr( attrs, 'ctime' )
1614
1615            if status == 'R':
1616
1617                start_timestamp = self.getAttr( attrs, 'mtime' )
1618                nodes           = self.getAttr( attrs, 'exec_host' ).split( '+' )
1619
1620                nodeslist       = do_nodelist( nodes )
1621
1622                if DETECT_TIME_DIFFS:
1623
1624                    # If a job start if later than our current date,
1625                    # that must mean the Torque server's time is later
1626                    # than our local time.
1627               
1628                    if int( start_timestamp ) > int( int( self.cur_time ) + int( self.timeoffset ) ):
1629
1630                        self.timeoffset = int( int(start_timestamp) - int(self.cur_time) )
1631
1632            elif status == 'Q':
1633
1634                # 'mynodequest' can be a string in the following syntax according to the
1635                # Torque Administator's manual:
1636                #
1637                # {<node_count> | <hostname>}[:ppn=<ppn>][:<property>[:<property>]...][+ ...]
1638                # {<node_count> | <hostname>}[:ppn=<ppn>][:<property>[:<property>]...][+ ...]
1639                # etc
1640                #
1641
1642                #
1643                # For now we only count the amount of nodes request and ignore properties
1644                #
1645
1646                start_timestamp = ''
1647                count_mynodes   = 0
1648
1649                for node in mynoderequest.split( '+' ):
1650
1651                    # Just grab the {node_count|hostname} part and ignore properties
1652                    #
1653                    nodepart     = node.split( ':' )[0]
1654
1655                    # Let's assume a node_count value
1656                    #
1657                    numeric_node = 1
1658
1659                    # Chop the value up into characters
1660                    #
1661                    for letter in nodepart:
1662
1663                        # If this char is not a digit (0-9), this must be a hostname
1664                        #
1665                        if letter not in string.digits:
1666
1667                            numeric_node = 0
1668
1669                    # If this is a hostname, just count this as one (1) node
1670                    #
1671                    if not numeric_node:
1672
1673                        count_mynodes = count_mynodes + 1
1674                    else:
1675
1676                        # If this a number, it must be the node_count
1677                        # and increase our count with it's value
1678                        #
1679                        try:
1680                            count_mynodes = count_mynodes + int( nodepart )
1681
1682                        except ValueError, detail:
1683
1684                            # When we arrive here I must be bugged or very confused
1685                            # THIS SHOULD NOT HAPPEN!
1686                            #
1687                            debug_msg( 10, str( detail ) )
1688                            debug_msg( 10, "Encountered weird node in Resources_List?!" )
1689                            debug_msg( 10, 'nodepart = ' + str( nodepart ) )
1690                            debug_msg( 10, 'job = ' + str( name ) )
1691                            debug_msg( 10, 'attrs = ' + str( attrs ) )
1692                       
1693                nodeslist       = str( count_mynodes )
1694            else:
1695                start_timestamp = ''
1696                nodeslist       = ''
1697
1698            myAttrs                = { }
1699
1700            myAttrs[ 'name' ]             = str( name )
1701            myAttrs[ 'queue' ]            = str( queue )
1702            myAttrs[ 'owner' ]            = str( owner )
1703            myAttrs[ 'requested_time' ]   = str( requested_time )
1704            myAttrs[ 'requested_memory' ] = str( requested_memory )
1705            myAttrs[ 'ppn' ]              = str( ppn )
1706            myAttrs[ 'status' ]           = str( status )
1707            myAttrs[ 'start_timestamp' ]  = str( start_timestamp )
1708            myAttrs[ 'queued_timestamp' ] = str( queued_timestamp )
1709            myAttrs[ 'reported' ]         = str( int( int( self.cur_time ) + int( self.timeoffset ) ) )
1710            myAttrs[ 'nodes' ]            = nodeslist
1711            myAttrs[ 'domain' ]           = fqdn_parts( socket.getfqdn() )[1]
1712            myAttrs[ 'poll_interval' ]    = str( BATCH_POLL_INTERVAL )
1713
1714            if self.jobDataChanged( self.jobs, job_id, myAttrs ) and myAttrs['status'] in [ 'R', 'Q' ]:
1715
1716                self.jobs[ job_id ] = myAttrs
1717
1718        for id, attrs in self.jobs.items():
1719
1720            if id not in jobs_processed:
1721
1722                # This one isn't there anymore; toedeledoki!
1723                #
1724                del self.jobs[ id ]
1725
1726GMETRIC_DEFAULT_TYPE    = 'string'
1727GMETRIC_DEFAULT_HOST    = '127.0.0.1'
1728GMETRIC_DEFAULT_PORT    = '8649'
1729GMETRIC_DEFAULT_UNITS   = ''
1730
1731class Gmetric:
1732
1733    global GMETRIC_DEFAULT_HOST, GMETRIC_DEFAULT_PORT
1734
1735    slope           = { 'zero' : 0, 'positive' : 1, 'negative' : 2, 'both' : 3, 'unspecified' : 4 }
1736    type            = ( '', 'string', 'uint16', 'int16', 'uint32', 'int32', 'float', 'double', 'timestamp' )
1737    protocol        = ( 'udp', 'multicast' )
1738
1739    def __init__( self, host=GMETRIC_DEFAULT_HOST, port=GMETRIC_DEFAULT_PORT ):
1740               
1741        global GMETRIC_DEFAULT_TYPE
1742
1743        self.prot       = self.checkHostProtocol( host )
1744        self.data_msg   = xdrlib.Packer()
1745        self.meta_msg   = xdrlib.Packer()
1746        self.socket     = socket.socket( socket.AF_INET, socket.SOCK_DGRAM )
1747
1748        if self.prot not in self.protocol:
1749
1750            raise ValueError( "Protocol must be one of: " + str( self.protocol ) )
1751
1752        if self.prot == 'multicast':
1753
1754            # Set multicast options
1755            #
1756            self.socket.setsockopt( socket.IPPROTO_IP, socket.IP_MULTICAST_TTL, 20 )
1757
1758        self.hostport   = ( host, int( port ) )
1759        self.slopestr   = 'both'
1760        self.tmax       = 60
1761
1762    def checkHostProtocol( self, ip ):
1763
1764        """Detect if a ip adress is a multicast address"""
1765
1766        MULTICAST_ADDRESS_MIN   = ( "224", "0", "0", "0" )
1767        MULTICAST_ADDRESS_MAX   = ( "239", "255", "255", "255" )
1768
1769        ip_fields               = ip.split( '.' )
1770
1771        if ip_fields >= MULTICAST_ADDRESS_MIN and ip_fields <= MULTICAST_ADDRESS_MAX:
1772
1773            return 'multicast'
1774        else:
1775            return 'udp'
1776
1777    def send( self, name, value, dmax, typestr = '', units = '' ):
1778
1779        if len( units ) == 0:
1780            units       = GMETRIC_DEFAULT_UNITS
1781
1782        if len( typestr ) == 0:
1783            typestr     = GMETRIC_DEFAULT_TYPE
1784
1785        (meta_msg, data_msg) = self.makexdr( name, value, typestr, units, self.slopestr, self.tmax, dmax )
1786
1787        meta_rt = self.socket.sendto( meta_msg, self.hostport )
1788        data_rt = self.socket.sendto( data_msg, self.hostport )
1789
1790        return ( meta_rt, data_rt )
1791
1792    def makexdr( self, name, value, typestr, unitstr, slopestr, tmax, dmax, group=None, spoof=None ):
1793
1794        hostname = "unset"
1795
1796        if slopestr not in self.slope:
1797
1798            raise ValueError( "Slope must be one of: " + str( self.slope.keys() ) )
1799
1800        if typestr not in self.type:
1801
1802            raise ValueError( "Type must be one of: " + str( self.type ) )
1803
1804        if len( name ) == 0:
1805
1806            raise ValueError( "Name must be non-empty" )
1807
1808        self.meta_msg.reset()
1809        self.meta_msg.pack_int( 128 )
1810
1811        if not spoof:
1812            self.meta_msg.pack_string( hostname )
1813        else:
1814            self.meta_msg.pack_string( spoof )
1815
1816        self.meta_msg.pack_string( name )
1817
1818        if not spoof:
1819            self.meta_msg.pack_int( 0 )
1820        else:
1821            self.meta_msg.pack_int( 1 )
1822           
1823        self.meta_msg.pack_string( typestr )
1824        self.meta_msg.pack_string( name )
1825        self.meta_msg.pack_string( unitstr )
1826        self.meta_msg.pack_int( self.slope[ slopestr ] )
1827        self.meta_msg.pack_uint( int( tmax ) )
1828        self.meta_msg.pack_uint( int( dmax ) )
1829
1830        if not group:
1831            self.meta_msg.pack_int( 0 )
1832        else:
1833            self.meta_msg.pack_int( 1 )
1834            self.meta_msg.pack_string( "GROUP" )
1835            self.meta_msg.pack_string( group )
1836
1837        self.data_msg.reset()
1838        self.data_msg.pack_int( 128+5 )
1839
1840        if not spoof:
1841            self.data_msg.pack_string( hostname )
1842        else:
1843            self.data_msg.pack_string( spoof )
1844
1845        self.data_msg.pack_string( name )
1846
1847        if not spoof:
1848            self.data_msg.pack_int( 0 )
1849        else:
1850            self.data_msg.pack_int( 1 )
1851
1852        self.data_msg.pack_string( "%s" )
1853        self.data_msg.pack_string( str( value ) )
1854
1855        return ( self.meta_msg.get_buffer(), self.data_msg.get_buffer() )
1856
1857def printTime( ):
1858
1859    """Print current time/date in human readable format for log/debug"""
1860
1861    return time.strftime("%a, %d %b %Y %H:%M:%S")
1862
1863def debug_msg( level, msg ):
1864
1865    """Print msg if at or above current debug level"""
1866
1867    global DAEMONIZE, DEBUG_LEVEL, SYSLOG_LEVEL
1868
1869    if (not DAEMONIZE and DEBUG_LEVEL >= level):
1870        sys.stderr.write( msg + '\n' )
1871
1872    if (DAEMONIZE and USE_SYSLOG and SYSLOG_LEVEL >= level):
1873        syslog.syslog( msg )
1874
1875def write_pidfile():
1876
1877    # Write pidfile if PIDFILE is set
1878    #
1879    if PIDFILE:
1880
1881        pid    = os.getpid()
1882
1883        pidfile    = open( PIDFILE, 'w' )
1884
1885        pidfile.write( str( pid ) )
1886        pidfile.close()
1887
1888def main():
1889
1890    """Application start"""
1891
1892    global PBSQuery, PBSError, lsfObject
1893    global SYSLOG_FACILITY, USE_SYSLOG, BATCH_API, DAEMONIZE
1894
1895    if not processArgs( sys.argv[1:] ):
1896
1897        sys.exit( 1 )
1898
1899    # Load appropriate DataGatherer depending on which BATCH_API is set
1900    # and any required modules for the Gatherer
1901    #
1902    if BATCH_API == 'pbs':
1903
1904        try:
1905            from PBSQuery import PBSQuery, PBSError
1906
1907        except ImportError, details:
1908
1909            print "FATAL ERROR: BATCH_API set to 'pbs' but python module 'pbs_python' cannot be loaded"
1910            print details
1911            sys.exit( 1 )
1912
1913        gather = PbsDataGatherer()
1914
1915    elif BATCH_API == 'sge':
1916
1917        # Tested with SGE 6.0u11.
1918        #
1919        gather = SgeDataGatherer()
1920
1921    elif BATCH_API == 'lsf':
1922
1923        try:
1924            from lsfObject import lsfObject
1925        except:
1926            print "FATAL ERROR: BATCH_API set to 'lsf' but python module is not found or installed"
1927            sys.exit( 1)
1928
1929        gather = LsfDataGatherer()
1930
1931    else:
1932        print "FATAL ERROR: unknown BATCH_API '" + BATCH_API + "' is not supported"
1933
1934        sys.exit( 1 )
1935
1936    if( DAEMONIZE and USE_SYSLOG ):
1937
1938        syslog.openlog( 'jobmond', syslog.LOG_NOWAIT, SYSLOG_FACILITY )
1939
1940    if DAEMONIZE:
1941
1942        gather.daemon()
1943    else:
1944        gather.run()
1945
1946# wh00t? someone started me! :)
1947#
1948if __name__ == '__main__':
1949    main()
Note: See TracBrowser for help on using the repository browser.